More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1006 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  100 
 
 		 543 aa  1108    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  45.51 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  36.07 
 
 		 564 aa  334  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  37.79 
 
 		 536 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  37.18 
 
 		 559 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  35.51 
 
 		 578 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  34.28 
 
 		 562 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  35 
 
 		 557 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  34.43 
 
 		 617 aa  257  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  32.6 
 
 		 564 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  33.57 
 
 		 543 aa  256  8e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  32.97 
 
 		 624 aa  246  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.82 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  33.95 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.44 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  31.86 
 
 		 600 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  31.24 
 
 		 592 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  30.89 
 
 		 611 aa  206  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  30.24 
 
 		 595 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  33.75 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.14 
 
 		 511 aa  203  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.21 
 
 		 539 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  30.98 
 
 		 598 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  28.21 
 
 		 544 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  29.11 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  29.26 
 
 		 598 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 		 523 aa  196  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  31.25 
 
 		 534 aa  193  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 		 586 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  29.62 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  28.95 
 
 		 598 aa  189  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  30.06 
 
 		 524 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.32 
 
 		 539 aa  188  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 		 581 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.99 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.67 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  30.47 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.32 
 
 		 539 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.32 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.32 
 
 		 539 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  27.86 
 
 		 539 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  29.54 
 
 		 524 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  31.45 
 
 		 540 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  28.2 
 
 		 619 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  31.18 
 
 		 556 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  29.53 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  29.59 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  31.34 
 
 		 580 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  29.16 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 		 543 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 		 619 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  28.35 
 
 		 520 aa  153  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.04 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.32 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.32 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.61 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  29.03 
 
 		 606 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  28.52 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.02 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  28.97 
 
 		 499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  30.66 
 
 		 968 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  25.82 
 
 		 572 aa  137  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.12 
 
 		 511 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.47 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  29 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  29.17 
 
 		 497 aa  130  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  27.94 
 
 		 496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.37 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.09 
 
 		 552 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 541 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  29.02 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  28.11 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  28.81 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  28.04 
 
 		 505 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  28.83 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  30.64 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.23 
 
 		 535 aa  123  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.57 
 
 		 529 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  28.41 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  29.39 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 540 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 551 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  29.11 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.98 
 
 		 569 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  27.47 
 
 		 531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 		 518 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.02 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  29.58 
 
 		 489 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  30.96 
 
 		 502 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  26.58 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  30.96 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  27.93 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  30.56 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30.96 
 
 		 502 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>