More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0227 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  59.35 
 
 
592 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  56.55 
 
 
595 aa  685    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
596 aa  1207    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  48.48 
 
 
586 aa  551  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  46.4 
 
 
584 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  45.61 
 
 
598 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  45.42 
 
 
597 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  46.75 
 
 
585 aa  525  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  45 
 
 
598 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  46.4 
 
 
580 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  44.86 
 
 
598 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  44.64 
 
 
619 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 
586 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  41.82 
 
 
600 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  39.03 
 
 
579 aa  398  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  38.59 
 
 
619 aa  393  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  38.8 
 
 
611 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  40.49 
 
 
522 aa  317  3e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  35.86 
 
 
590 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.24 
 
 
539 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.96 
 
 
545 aa  263  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.07 
 
 
539 aa  261  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.21 
 
 
544 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.21 
 
 
539 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.9 
 
 
539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.35 
 
 
539 aa  253  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.03 
 
 
539 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  35.16 
 
 
556 aa  249  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.78 
 
 
541 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.33 
 
 
543 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  32.71 
 
 
524 aa  246  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  30.69 
 
 
544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  32.83 
 
 
555 aa  240  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.09 
 
 
531 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  30.69 
 
 
539 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  33.39 
 
 
523 aa  234  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  32.98 
 
 
554 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  29.52 
 
 
511 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  31.91 
 
 
543 aa  209  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 
504 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  31.62 
 
 
564 aa  196  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  30.45 
 
 
557 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  29.51 
 
 
564 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  30.07 
 
 
606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  29.9 
 
 
559 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 
524 aa  177  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  30.15 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  30.68 
 
 
578 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  27.78 
 
 
624 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  30.86 
 
 
617 aa  169  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  31.73 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  28.95 
 
 
519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.7 
 
 
512 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 
543 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36.61 
 
 
506 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  34.44 
 
 
529 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  34.68 
 
 
498 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.56 
 
 
537 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.4 
 
 
968 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.31 
 
 
537 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.31 
 
 
537 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 
536 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.61 
 
 
553 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  35.01 
 
 
508 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  33.78 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  33.69 
 
 
502 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  33.51 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  33.78 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
511 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
518 aa  143  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.89 
 
 
478 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  29.23 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.34 
 
 
478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.34 
 
 
478 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.36 
 
 
481 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.64 
 
 
546 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 
477 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  29.2 
 
 
489 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
552 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.49 
 
 
537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.83 
 
 
547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  33.06 
 
 
475 aa  137  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  28.93 
 
 
504 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.52 
 
 
534 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  30.95 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  31.58 
 
 
479 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.34 
 
 
486 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  31.15 
 
 
388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  34.81 
 
 
493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  31.02 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 
488 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
486 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  30.58 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.7 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  30.25 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 
499 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
544 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>