More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4076 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1179    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  36.89 
 
 		 559 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  35.64 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  35.48 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  34.42 
 
 		 562 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  33.16 
 
 		 564 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  34.91 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  34.93 
 
 		 557 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  32.91 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  30.9 
 
 		 617 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  29.48 
 
 		 624 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  30.33 
 
 		 592 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.2 
 
 		 539 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  28.39 
 
 		 539 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  28.94 
 
 		 597 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  27.7 
 
 		 544 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.69 
 
 		 539 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  28.62 
 
 		 543 aa  177  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.09 
 
 		 541 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 		 596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  28.04 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  28.4 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.01 
 
 		 539 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 		 595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07251  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 		 581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.261689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  27.94 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  26.85 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  29.67 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  26.75 
 
 		 539 aa  163  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  27.19 
 
 		 598 aa  163  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.76 
 
 		 544 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  27.76 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  28.92 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  26.64 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  29.08 
 
 		 600 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  27.79 
 
 		 598 aa  150  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 		 523 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  29.53 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  25.69 
 
 		 579 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  28.6 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  28.85 
 
 		 611 aa  143  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  27.02 
 
 		 590 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  29.66 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.44 
 
 		 534 aa  137  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  27.39 
 
 		 520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  30.19 
 
 		 556 aa  134  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.5 
 
 		 531 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  27.92 
 
 		 598 aa  133  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  26.64 
 
 		 504 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.64 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.64 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  28.75 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  25.68 
 
 		 585 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  28.73 
 
 		 497 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.14 
 
 		 580 aa  126  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.38 
 
 		 537 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  30.67 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  27.51 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  28.18 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.41 
 
 		 533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.55 
 
 		 552 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.95 
 
 		 511 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.88 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  32.19 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  26.9 
 
 		 496 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  30.2 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.06 
 
 		 544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  26.29 
 
 		 535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  23.99 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  28.64 
 
 		 497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  27.32 
 
 		 511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  27.14 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  25.87 
 
 		 545 aa  110  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  29.14 
 
 		 537 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  26.12 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  26.12 
 
 		 478 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  26.41 
 
 		 499 aa  110  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  29.2 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  27.26 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  29.35 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  28.04 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  25.05 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 577 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  28.79 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 583 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  27.01 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.44 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.44 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  27.45 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  27.61 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>