More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0131 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  100 
 
 		 556 aa  1120    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 584 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 		 596 aa  263  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.04 
 
 		 543 aa  243  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  32.71 
 
 		 595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  32.3 
 
 		 592 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  31.84 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  34.22 
 
 		 524 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  31.83 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.2 
 
 		 545 aa  230  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.26 
 
 		 539 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  34.43 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  30.24 
 
 		 539 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.36 
 
 		 544 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.36 
 
 		 539 aa  224  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  31.08 
 
 		 539 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  31.75 
 
 		 580 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  32.45 
 
 		 586 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.12 
 
 		 539 aa  220  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.48 
 
 		 539 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.18 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  30.66 
 
 		 544 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  30.38 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.39 
 
 		 541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  31.84 
 
 		 598 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  30.69 
 
 		 619 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  32.24 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  32.42 
 
 		 555 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  30.31 
 
 		 585 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.12 
 
 		 531 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  31.17 
 
 		 611 aa  203  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  31.11 
 
 		 598 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  32.31 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  31.3 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  31.24 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  33.82 
 
 		 519 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0584184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  31.24 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  31.79 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  31.48 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  30.91 
 
 		 564 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  30.2 
 
 		 624 aa  180  7e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  31.75 
 
 		 520 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  30.67 
 
 		 543 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  30.97 
 
 		 617 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  35.19 
 
 		 537 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  34.75 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  34.75 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  30.71 
 
 		 536 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  29.4 
 
 		 543 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.83 
 
 		 554 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  31.04 
 
 		 564 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  32.19 
 
 		 968 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 		 486 aa  151  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.17 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 		 534 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  35.6 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 619 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.57 
 
 		 535 aa  146  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  34.28 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  34.69 
 
 		 493 aa  145  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.51 
 
 		 461 aa  144  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  29.75 
 
 		 559 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.06 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  32.89 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  32.09 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  34.71 
 
 		 502 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  34.63 
 
 		 502 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  34.71 
 
 		 502 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 557 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.79 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.79 
 
 		 478 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  31.64 
 
 		 544 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  29.26 
 
 		 524 aa  140  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 		 486 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  32.89 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  34.35 
 
 		 502 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 		 518 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  32.2 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  32.22 
 
 		 531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.33 
 
 		 537 aa  137  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  27.4 
 
 		 530 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 541 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  30.44 
 
 		 547 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  33.07 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  26.7 
 
 		 578 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.86 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  33.88 
 
 		 548 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  33.6 
 
 		 574 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  35.08 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  31.72 
 
 		 571 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.7 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  31.46 
 
 		 520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>