More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3000 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  68.91 
 
 		 561 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 551 aa  1119    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  52.83 
 
 		 564 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  52.73 
 
 		 570 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  52.43 
 
 		 577 aa  543  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  52.33 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  50.55 
 
 		 588 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 583 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  48.58 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  47.83 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  44.64 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  43.43 
 
 		 578 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  39.59 
 
 		 535 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 553 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  39.36 
 
 		 553 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  38.91 
 
 		 545 aa  361  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  39.55 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  39.17 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 545 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 555 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 553 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 553 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 579 aa  351  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  38.56 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 541 aa  348  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 559 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 559 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 550 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 584 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  40.35 
 
 		 563 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 554 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  36.16 
 
 		 570 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  37.73 
 
 		 569 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  40.45 
 
 		 540 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 569 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  37.28 
 
 		 578 aa  325  9e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  39.6 
 
 		 540 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 541 aa  316  7e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  35.94 
 
 		 524 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 535 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 546 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 544 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  37.62 
 
 		 535 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  35.27 
 
 		 550 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  39.1 
 
 		 550 aa  280  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  33.52 
 
 		 585 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.12 
 
 		 554 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  33.76 
 
 		 594 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 		 547 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  36.25 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  30.91 
 
 		 504 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  32.73 
 
 		 484 aa  191  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.46 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  31.76 
 
 		 546 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.03 
 
 		 580 aa  166  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  35.07 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  29.86 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  30.34 
 
 		 501 aa  153  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.82 
 
 		 531 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  31.79 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.43 
 
 		 414 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.07 
 
 		 569 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.53 
 
 		 506 aa  150  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  31.71 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.27 
 
 		 568 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.27 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.27 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  29.63 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  28.25 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.39 
 
 		 569 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.9 
 
 		 529 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 		 511 aa  143  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.31 
 
 		 552 aa  143  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  31.27 
 
 		 547 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  29.68 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  30.61 
 
 		 511 aa  139  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.53 
 
 		 574 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  28.13 
 
 		 537 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 		 554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  27.99 
 
 		 549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.95 
 
 		 537 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.95 
 
 		 537 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.7 
 
 		 500 aa  134  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4409  monooxygenase, FAD-binding  31.7 
 
 		 405 aa  133  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.27 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.08 
 
 		 554 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  27.58 
 
 		 552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  27.08 
 
 		 554 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>