More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0422 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.56 
 
 
554 aa  1132    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
554 aa  1145    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.28 
 
 
554 aa  1137    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  99.28 
 
 
554 aa  1138    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  99.1 
 
 
554 aa  1136    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.56 
 
 
554 aa  1132    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  98.38 
 
 
554 aa  1130    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  68.54 
 
 
555 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  99.28 
 
 
554 aa  1137    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.51 
 
 
622 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.18 
 
 
618 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  52.56 
 
 
615 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.35 
 
 
569 aa  511  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.36 
 
 
573 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.36 
 
 
573 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.36 
 
 
568 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.13 
 
 
561 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  47.23 
 
 
569 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.95 
 
 
574 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.5 
 
 
542 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.5 
 
 
542 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  40.84 
 
 
564 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.83 
 
 
552 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.55 
 
 
605 aa  340  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.51 
 
 
580 aa  333  6e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.18 
 
 
547 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  35.37 
 
 
587 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  32.56 
 
 
520 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  33.26 
 
 
570 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  33.26 
 
 
570 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  33.49 
 
 
565 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  32.66 
 
 
537 aa  231  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.4 
 
 
503 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.55 
 
 
520 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.3 
 
 
530 aa  223  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.44 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  29.2 
 
 
525 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  30.54 
 
 
530 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  30.96 
 
 
514 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  31.12 
 
 
481 aa  210  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.06 
 
 
507 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  29.45 
 
 
509 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 
497 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.13 
 
 
555 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.42 
 
 
597 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
537 aa  187  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 
555 aa  187  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  28.3 
 
 
518 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.66 
 
 
523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.2 
 
 
511 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 
503 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  31.51 
 
 
570 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
577 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  25.7 
 
 
541 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  30.46 
 
 
504 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  26.48 
 
 
583 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  32.22 
 
 
506 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  29.79 
 
 
588 aa  150  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
581 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  29.47 
 
 
535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  34.68 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  27.78 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.45 
 
 
547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.67 
 
 
537 aa  146  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
540 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  28.85 
 
 
498 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
524 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  31.54 
 
 
561 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  34.4 
 
 
479 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  27.61 
 
 
546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.01 
 
 
475 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  29.54 
 
 
545 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
555 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  29.55 
 
 
544 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  27.24 
 
 
570 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  33.42 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  25.81 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  24.31 
 
 
545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  30.92 
 
 
497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  30.75 
 
 
489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.97 
 
 
529 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
550 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  31.62 
 
 
481 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.75 
 
 
533 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  27.65 
 
 
553 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
540 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
584 aa  133  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  28.22 
 
 
558 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2111  monooxygenase, FAD-binding  29.86 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0054618  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.08 
 
 
551 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  29.8 
 
 
497 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.35 
 
 
537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.35 
 
 
537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  28.86 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.17 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>