More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5774 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  72.14 
 
 
547 aa  739    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
570 aa  1141    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  96.81 
 
 
565 aa  1048    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
570 aa  1141    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.82 
 
 
605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.19 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  34.96 
 
 
547 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.32 
 
 
580 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.64 
 
 
542 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.64 
 
 
542 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.37 
 
 
555 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  31.67 
 
 
587 aa  259  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  36.61 
 
 
514 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  35.82 
 
 
530 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  40.27 
 
 
497 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.55 
 
 
554 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.55 
 
 
554 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.55 
 
 
554 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.48 
 
 
554 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  32.48 
 
 
554 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.48 
 
 
569 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.26 
 
 
554 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.55 
 
 
554 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  32.27 
 
 
554 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.33 
 
 
622 aa  248  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.73 
 
 
618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.19 
 
 
568 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.19 
 
 
573 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.19 
 
 
573 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.59 
 
 
615 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  34.87 
 
 
520 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.68 
 
 
509 aa  230  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.47 
 
 
507 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.71 
 
 
569 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  35.12 
 
 
525 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.46 
 
 
561 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  41.6 
 
 
509 aa  217  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.77 
 
 
503 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.26 
 
 
520 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.58 
 
 
530 aa  209  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  37.7 
 
 
503 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  36.29 
 
 
518 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  37.18 
 
 
537 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.11 
 
 
574 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  35.01 
 
 
481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.41 
 
 
555 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.45 
 
 
511 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.48 
 
 
597 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.66 
 
 
537 aa  191  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.5 
 
 
555 aa  189  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.33 
 
 
523 aa  189  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  31.54 
 
 
564 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  35.52 
 
 
511 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.38 
 
 
481 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
561 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.05 
 
 
554 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  31.85 
 
 
493 aa  143  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  31.41 
 
 
486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  33.89 
 
 
553 aa  140  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
511 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.97 
 
 
388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  35.23 
 
 
488 aa  137  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  32.24 
 
 
537 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  32.24 
 
 
537 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  32.24 
 
 
537 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 
500 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  28.41 
 
 
586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  33.24 
 
 
475 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.58 
 
 
547 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  30.57 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.29 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  29.12 
 
 
533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.32 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  27.02 
 
 
592 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 
535 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  31.66 
 
 
486 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.1 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  29.81 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.35 
 
 
489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  31.59 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  32.2 
 
 
485 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  27.43 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 
475 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  26.96 
 
 
584 aa  126  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.91 
 
 
566 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
545 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.42 
 
 
494 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 
506 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  33.14 
 
 
477 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  30.59 
 
 
552 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  30.34 
 
 
598 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  30.71 
 
 
541 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  27.61 
 
 
555 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  32.12 
 
 
515 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>