More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1344 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  100 
 
 
561 aa  1130    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  54.6 
 
 
574 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.47 
 
 
569 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.26 
 
 
568 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.45 
 
 
573 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.45 
 
 
573 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  53.72 
 
 
569 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  52.32 
 
 
564 aa  548  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  49.18 
 
 
555 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.76 
 
 
554 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.76 
 
 
554 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.76 
 
 
554 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.76 
 
 
554 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.4 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  46.22 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  46.4 
 
 
554 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.22 
 
 
554 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  46.11 
 
 
618 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  45.39 
 
 
622 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  44.54 
 
 
615 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.83 
 
 
542 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.83 
 
 
542 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.66 
 
 
552 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.22 
 
 
547 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.89 
 
 
605 aa  307  4.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.7 
 
 
580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 
587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  33.7 
 
 
520 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 
565 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  35.01 
 
 
570 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  35.01 
 
 
570 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.83 
 
 
509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  31.65 
 
 
547 aa  213  9e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  30.47 
 
 
525 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  34.05 
 
 
537 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.42 
 
 
520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.29 
 
 
507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  36.18 
 
 
509 aa  194  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  33.88 
 
 
497 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.96 
 
 
555 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  29.44 
 
 
530 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.88 
 
 
503 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  33.92 
 
 
537 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.23 
 
 
555 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 
518 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  29.33 
 
 
514 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.19 
 
 
530 aa  178  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.83 
 
 
597 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  33.07 
 
 
503 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  29.59 
 
 
481 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.19 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.5 
 
 
523 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  32.04 
 
 
512 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  29.34 
 
 
553 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
553 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
553 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
559 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  29.14 
 
 
559 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
570 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  27.48 
 
 
550 aa  136  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
553 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
583 aa  134  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.05 
 
 
584 aa  133  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 
533 aa  133  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  31.76 
 
 
537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
550 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  30.38 
 
 
522 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.08 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.08 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.08 
 
 
537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
540 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.18 
 
 
554 aa  130  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  30.86 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  29.43 
 
 
577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  27.31 
 
 
558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  31 
 
 
497 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  27.37 
 
 
550 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
541 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  31.16 
 
 
494 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
555 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
569 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  32.68 
 
 
488 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  30.22 
 
 
555 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.68 
 
 
506 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  33.43 
 
 
402 aa  125  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  28.7 
 
 
531 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  28.84 
 
 
578 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
545 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
553 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  30.14 
 
 
408 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
553 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  29.95 
 
 
553 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.14 
 
 
529 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  28.04 
 
 
546 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>