More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5585 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5585  putative FAD-binding monooxygenase  100 
 
 
514 aa  1046    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  59.34 
 
 
520 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  56.74 
 
 
530 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  40.5 
 
 
525 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  41.24 
 
 
503 aa  340  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  39.41 
 
 
518 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  40.73 
 
 
497 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.57 
 
 
503 aa  299  8e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.57 
 
 
507 aa  299  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.99 
 
 
509 aa  297  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  36.59 
 
 
520 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1268  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  36.76 
 
 
530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  38.63 
 
 
570 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  38.63 
 
 
570 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.59 
 
 
542 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.59 
 
 
542 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  38.19 
 
 
565 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  35.19 
 
 
509 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  40.05 
 
 
547 aa  243  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  31.68 
 
 
587 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.7 
 
 
555 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.78 
 
 
605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.59 
 
 
552 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.52 
 
 
580 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  35.07 
 
 
481 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3290  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.17 
 
 
523 aa  224  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.03 
 
 
555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.27 
 
 
597 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  34.43 
 
 
537 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.08 
 
 
555 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.35 
 
 
554 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  31.35 
 
 
554 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  34.83 
 
 
547 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  31.35 
 
 
554 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.58 
 
 
569 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.54 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.86 
 
 
573 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.86 
 
 
573 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.67 
 
 
568 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.17 
 
 
569 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.81 
 
 
574 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.97 
 
 
622 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  33.41 
 
 
537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.8 
 
 
618 aa  187  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.61 
 
 
615 aa  186  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.17 
 
 
561 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  28.21 
 
 
564 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  27.77 
 
 
541 aa  156  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  32.52 
 
 
511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  34.97 
 
 
481 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  34.17 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  33.52 
 
 
518 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.03 
 
 
505 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.88 
 
 
511 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  25.71 
 
 
575 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  30.4 
 
 
414 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
540 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  27.13 
 
 
540 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.1 
 
 
550 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  30.31 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  31.79 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  30.84 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.83 
 
 
550 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
559 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
559 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 
531 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 
547 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
486 aa  133  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.69 
 
 
547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  32.9 
 
 
480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  27.03 
 
 
563 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.05 
 
 
529 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
564 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.14 
 
 
554 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.22 
 
 
511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  28.85 
 
 
551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  26.06 
 
 
535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  30.71 
 
 
546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  28 
 
 
570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  29.23 
 
 
477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  26.86 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.05 
 
 
548 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.38 
 
 
486 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  28.73 
 
 
544 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
583 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  29.55 
 
 
550 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  32.13 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  27.37 
 
 
511 aa  127  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
549 aa  126  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
594 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>