More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1039 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1039  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 402 aa  817    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.460547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  42.46 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6603  monooxygenase FAD-binding protein  39.66 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145948  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  35.68 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  34.29 
 
 		 537 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.71 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  32.66 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  35.07 
 
 		 497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  34.47 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  30.32 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.22 
 
 		 537 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.3 
 
 		 537 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.3 
 
 		 537 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  34.15 
 
 		 497 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  31.62 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.19 
 
 		 546 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.65 
 
 		 573 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.65 
 
 		 573 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.65 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  34.15 
 
 		 497 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  34.08 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  32.69 
 
 		 477 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.72 
 
 		 481 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.61 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.61 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.1 
 
 		 529 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 		 522 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.72 
 
 		 580 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  33.98 
 
 		 475 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  32.76 
 
 		 511 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  31.43 
 
 		 535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  33.43 
 
 		 561 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  32.04 
 
 		 547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 550 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  30.37 
 
 		 544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  31.87 
 
 		 503 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  29.89 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  33.91 
 
 		 488 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  31.04 
 
 		 572 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 541 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.47 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  30.96 
 
 		 486 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  32.46 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  34.16 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.88 
 
 		 605 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.81 
 
 		 553 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  30.79 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.06 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  31.48 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  31.32 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  31.73 
 
 		 525 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  30.34 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  33.43 
 
 		 563 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.1 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 555 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  30 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3372  monooxygenase FAD-binding protein  33.61 
 
 		 553 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  32.17 
 
 		 556 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.85 
 
 		 548 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.85 
 
 		 548 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  30.22 
 
 		 566 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 		 548 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 555 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.25 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  28.21 
 
 		 534 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 584 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 553 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 553 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 553 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.4 
 
 		 505 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.33 
 
 		 968 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  31.74 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  33.53 
 
 		 504 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 540 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 553 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.41 
 
 		 552 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  30.89 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  34.44 
 
 		 496 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 524 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.44 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  29.56 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04002  monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09540)  28.57 
 
 		 573 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.455437 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 579 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  28.34 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  31.43 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  29.54 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>