More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0653 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0653  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 484 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18980  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  54.24 
 
 		 554 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.099299  normal  0.679289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1919  monooxygenase FAD-binding protein  54.87 
 
 		 547 aa  490  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1867  monooxygenase FAD-binding protein  50.89 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3777  monooxygenase FAD-binding protein  45.96 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  hitchhiker  0.00382559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0814  monooxygenase FAD-binding  47.31 
 
 		 525 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0924  FAD-dependent oxidoreductase  34.13 
 
 		 541 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 535 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0903  FAD-dependent oxidoreductase  34.65 
 
 		 540 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  38.01 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  35.91 
 
 		 545 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0776  FAD-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 524 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.790337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1196  FAD-dependent oxidoreductase  37.12 
 
 		 554 aa  250  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5156  FAD-dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 535 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4535  FAD-dependent oxidoreductase  35.75 
 
 		 563 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000237964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  38.92 
 
 		 558 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0563  FAD-dependent oxidoreductase  38.62 
 
 		 544 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0428  FAD-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 569 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00420765  normal  0.845447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1015  FAD-dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 540 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.18031  normal  0.166528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4300  FAD-dependent oxidoreductase  37.63 
 
 		 578 aa  246  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  38.05 
 
 		 555 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3910  FAD-dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 550 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 553 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0715  FAD-dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 558 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.520934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2566  FAD-dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 555 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 569 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3177  FAD-dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 553 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0698  FAD-dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2624  FAD-dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.596702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0786  FAD-dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 553 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3216  FAD-dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3231  FAD-dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0334  FAD-dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0817  FAD-dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 553 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0834776  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4529  FAD-dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 559 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.609398  normal  0.38599 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4661  FAD-dependent oxidoreductase  36.38 
 
 		 559 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.135002 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2685  FAD-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0853  FAD-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1924  FAD-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.421754  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2059  FAD-dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 553 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1432  FAD-dependent oxidoreductase  36.04 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.886265  normal  0.829223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 570 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3815  FAD-dependent oxidoreductase  35.84 
 
 		 541 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.433248  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0339  FAD-dependent oxidoreductase  37.15 
 
 		 584 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0888  FAD-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 535 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2727  FAD-dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00614764  normal  0.0524365 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4123  FAD-dependent oxidoreductase  36.11 
 
 		 577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000743874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01747  FAD-dependent oxidoreductase  36.58 
 
 		 563 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.178537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3422  monooxygenase, FAD-binding  33.46 
 
 		 550 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 564 aa  220  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  35.66 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3718  monooxygenase, FAD-binding  35.45 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5380  FAD-dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 583 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189642  normal  0.0809664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5105  monooxygenase FAD-binding  34.24 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  33.56 
 
 		 588 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.240433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3000  FAD-dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 551 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.296257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4008  monooxygenase FAD-binding  34.41 
 
 		 578 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal  0.525361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4781  monooxygenase FAD-binding  32.62 
 
 		 572 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3526  monooxygenase, FAD-binding  34.41 
 
 		 586 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.120911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4632  monooxygenase, FAD-binding  31.7 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2311  monooxygenase FAD-binding protein  34.46 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  29.14 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2290  monooxygenase FAD-binding protein  33.64 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  28.98 
 
 		 461 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4409  monooxygenase, FAD-binding  34.2 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  25.55 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  29.63 
 
 		 547 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3038  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 		 409 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  29.49 
 
 		 414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 		 500 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0297  monooxygenase FAD-binding protein  34.09 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 		 518 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  29.75 
 
 		 481 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  31.61 
 
 		 506 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  33.64 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  26.94 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  31.94 
 
 		 525 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  27.47 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  27.75 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  26.7 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  28.08 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  27.75 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  28.89 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  31.06 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  29.57 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  30.79 
 
 		 549 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.87 
 
 		 580 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  30.2 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  30.2 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.85 
 
 		 552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  30.59 
 
 		 548 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  30.77 
 
 		 548 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.03 
 
 		 605 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  29.91 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  28.06 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.88 
 
 		 529 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  29.16 
 
 		 565 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>