126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2991 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.748678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0725  monooxygenase FAD-binding protein  54.46 
 
 		 509 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.812372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4906  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  48.65 
 
 		 511 aa  159  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2814  monooxygenase FAD-binding protein  41.54 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0957884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4947  monooxygenase FAD-binding protein  39.25 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6487  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.15 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6722  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.15 
 
 		 542 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.792631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  37.1 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0593  monooxygenase, FAD-binding  31.28 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5808  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  31.51 
 
 		 552 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0990  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.5 
 
 		 507 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1979  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.35 
 
 		 555 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.623617  normal  0.147267 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.16 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0616  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  40.96 
 
 		 580 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  34.07 
 
 		 622 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3790  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.27 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0270  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.16 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385681  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3786  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.27 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3859  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.27 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5524  monooxygenase FAD-binding  52.83 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1344  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  38.27 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.430096  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00301  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.46 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00155662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.46 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00305  hypothetical protein  26.46 
 
 		 554 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00161031  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0422  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  25.56 
 
 		 554 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1541  monooxygenase FAD-binding  28.5 
 
 		 497 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3259  monooxygenase FAD-binding protein  26.01 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.257115  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2401  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.96 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.01 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.01 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2893  monooxygenase FAD-binding  33.33 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  26.01 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.83 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6461  monooxygenase FAD-binding  30.07 
 
 		 537 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0929587  normal  0.112964 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  37.35 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4245  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  32.97 
 
 		 569 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.525028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4747  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.03 
 
 		 574 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1569  monooxygenase, FAD-binding  33.57 
 
 		 525 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  54.17 
 
 		 547 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  50 
 
 		 570 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  50 
 
 		 570 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  42.25 
 
 		 511 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3413  monooxygenase, FAD-binding  26.18 
 
 		 503 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0619698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4483  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.67 
 
 		 555 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 565 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3513  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 		 587 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08756  phenol monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03030)  31.76 
 
 		 693 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  54.35 
 
 		 553 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  39.39 
 
 		 544 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  38.57 
 
 		 496 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.52 
 
 		 478 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  58.33 
 
 		 473 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.52 
 
 		 478 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  58.33 
 
 		 473 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  34.52 
 
 		 478 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  58.33 
 
 		 473 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4834  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  41.82 
 
 		 597 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447643  decreased coverage  0.00803206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  52.17 
 
 		 529 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  50 
 
 		 486 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  51.16 
 
 		 490 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  45.45 
 
 		 574 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  45.45 
 
 		 574 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  47.73 
 
 		 485 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  38.24 
 
 		 486 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  50 
 
 		 506 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  46.51 
 
 		 493 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  35.92 
 
 		 388 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 477 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0161  monooxygenase, FAD-binding  26.15 
 
 		 530 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4203  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  42 
 
 		 555 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  47.73 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  25.37 
 
 		 520 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  47.73 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  33.05 
 
 		 503 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  48.84 
 
 		 552 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  31.67 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  47.73 
 
 		 548 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  45.45 
 
 		 571 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  50 
 
 		 497 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  45.45 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  43.64 
 
 		 611 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  47.73 
 
 		 550 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  55.56 
 
 		 494 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 548 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 548 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  51.16 
 
 		 546 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  44.68 
 
 		 590 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0928  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  28.99 
 
 		 509 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  32.26 
 
 		 549 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  55.56 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  47.73 
 
 		 550 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  44.68 
 
 		 497 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  42.55 
 
 		 497 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  34.25 
 
 		 499 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  48.72 
 
 		 492 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  38.6 
 
 		 502 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  38.6 
 
 		 502 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  38.6 
 
 		 502 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  50 
 
 		 501 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>