More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2199 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
492 aa  974    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  56.01 
 
 
486 aa  524  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  55.49 
 
 
489 aa  502  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  50.41 
 
 
503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  47.14 
 
 
503 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  44.53 
 
 
490 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  44.14 
 
 
494 aa  339  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  43.5 
 
 
497 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  43.89 
 
 
475 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  41.01 
 
 
488 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  41.85 
 
 
497 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  41.21 
 
 
496 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  42.12 
 
 
479 aa  313  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  48.57 
 
 
630 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  41.01 
 
 
489 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  40.28 
 
 
499 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  42.6 
 
 
477 aa  307  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  42.32 
 
 
475 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  41.9 
 
 
497 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  41.7 
 
 
567 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  39.75 
 
 
471 aa  293  3e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 
473 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  40 
 
 
473 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  40 
 
 
473 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  40.94 
 
 
492 aa  279  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  39.76 
 
 
489 aa  273  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  40.04 
 
 
496 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  38.71 
 
 
474 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  37.68 
 
 
526 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  39.96 
 
 
479 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  38.31 
 
 
515 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  37.88 
 
 
506 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  38.84 
 
 
488 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  34.72 
 
 
519 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  35.84 
 
 
578 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  35.69 
 
 
506 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  33.78 
 
 
515 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  36.98 
 
 
522 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  38.01 
 
 
508 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  30.91 
 
 
483 aa  223  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  35.65 
 
 
518 aa  223  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  37.19 
 
 
485 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  35.38 
 
 
509 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.15 
 
 
483 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  37.16 
 
 
515 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  33.52 
 
 
509 aa  203  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  36.38 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  34.95 
 
 
493 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  33.06 
 
 
486 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  32.93 
 
 
477 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  34.3 
 
 
480 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  34.22 
 
 
479 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  32.68 
 
 
503 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.45 
 
 
535 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  36.12 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.38 
 
 
478 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.56 
 
 
537 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.38 
 
 
478 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.56 
 
 
537 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.56 
 
 
537 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  31.77 
 
 
505 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.36 
 
 
540 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  31.51 
 
 
544 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  33.61 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  30.99 
 
 
500 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  31.9 
 
 
506 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.34 
 
 
548 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.34 
 
 
548 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  31.2 
 
 
549 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  33.95 
 
 
512 aa  159  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  30.4 
 
 
550 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.42 
 
 
529 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.77 
 
 
547 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.72 
 
 
505 aa  158  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.34 
 
 
611 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.77 
 
 
548 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.77 
 
 
548 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  30.19 
 
 
574 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  31.73 
 
 
553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  35.13 
 
 
548 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  35.13 
 
 
548 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  34.19 
 
 
548 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.48 
 
 
538 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  34.48 
 
 
538 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  32.78 
 
 
506 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  34.28 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  29.25 
 
 
574 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  30.04 
 
 
550 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 
493 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  29.32 
 
 
511 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  33.5 
 
 
461 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  35.26 
 
 
498 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  37.29 
 
 
477 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  28.05 
 
 
566 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  33.66 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  36.29 
 
 
546 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  35.14 
 
 
414 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  34.66 
 
 
515 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  34.66 
 
 
515 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.416517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>