More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1223 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  100 
 
 		 471 aa  914    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  54.43 
 
 		 630 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  42.17 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  46.84 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  40.12 
 
 		 489 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  39.92 
 
 		 503 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  39.75 
 
 		 492 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  38.62 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  38.59 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  39.07 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  39 
 
 		 475 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  36.85 
 
 		 497 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  38.45 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  39.68 
 
 		 475 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  38.45 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  35.05 
 
 		 497 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  39.44 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  36.7 
 
 		 488 aa  216  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  40.64 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  34.2 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.17 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.17 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.17 
 
 		 473 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  38.05 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  34.52 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  38.9 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  37.32 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  34.92 
 
 		 489 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  37.5 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  34.71 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.33 
 
 		 526 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  35.67 
 
 		 567 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  35.44 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  37.11 
 
 		 479 aa  189  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  35.33 
 
 		 508 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  29.59 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  36.87 
 
 		 522 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.88 
 
 		 483 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  34.48 
 
 		 480 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  33.95 
 
 		 578 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  33.46 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 		 486 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  37.93 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.34 
 
 		 478 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  34.1 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  34.1 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  32.75 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  34.74 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  35.71 
 
 		 485 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 		 506 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  35.52 
 
 		 493 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  35.7 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  32.89 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  35.24 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  33.07 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  36.93 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  33.12 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  35.52 
 
 		 540 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  35.57 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  36.76 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  34.69 
 
 		 506 aa  150  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  33.01 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.69 
 
 		 481 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.7 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 		 505 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  34.34 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  31.77 
 
 		 529 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  32.48 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  33.41 
 
 		 486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  35 
 
 		 500 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36.25 
 
 		 489 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 		 547 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  27.95 
 
 		 544 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 		 552 aa  136  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.7 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  33.89 
 
 		 968 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  36.18 
 
 		 547 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  33.75 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  31.5 
 
 		 502 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  31.7 
 
 		 502 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1511  monooxygenase FAD-binding  35.82 
 
 		 576 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0685394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 		 540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  30.3 
 
 		 512 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  37.33 
 
 		 546 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  35.53 
 
 		 498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  35.5 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.28 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  31.41 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.99 
 
 		 510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  29.93 
 
 		 574 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  31.13 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3183  monooxygenase FAD-binding  34.07 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  32.04 
 
 		 548 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 		 548 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  32.13 
 
 		 548 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  31.52 
 
 		 548 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  35.17 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>