13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6344 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6344  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126188  decreased coverage  0.0000382354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3375  hypothetical protein  39.74 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382762  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3110  hypothetical protein  34.27 
 
 
232 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00606193  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1364  hypothetical protein  36.08 
 
 
137 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1473  hypothetical protein  30.92 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3970  hypothetical protein  31.87 
 
 
164 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  39.42 
 
 
848 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2013  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  42.05 
 
 
623 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4552  hypothetical protein  44 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  35.35 
 
 
228 aa  45.1  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3766  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
428 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  36.25 
 
 
2821 aa  41.6  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>