More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0878 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1093  ribonuclease, Rne/Rng family  59.58 
 
 		 653 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0668  ribonuclease, Rne/Rng family  62.02 
 
 		 713 aa  716    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1064  ribonuclease, Rne/Rng family  59.58 
 
 		 653 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1281  ribonuclease E and G  61.87 
 
 		 687 aa  708    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000695712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0878  ribonuclease  100 
 
 		 808 aa  1620    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0042  ribonuclease, Rne/Rng family  74.2 
 
 		 645 aa  681    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0483  ribonuclease  62.33 
 
 		 682 aa  698    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.582828  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3404  ribonuclease, Rne/Rng family  80.39 
 
 		 669 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23721  ribonuclease E/G  69.38 
 
 		 647 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16241  ribonuclease E/G  64.81 
 
 		 624 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1067  RNAse E  65.76 
 
 		 640 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.232877  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19421  ribonuclease E/G  66.01 
 
 		 640 aa  562  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.839153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16921  ribonuclease E/G  61.8 
 
 		 602 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.987709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16811  ribonuclease E/G  60.58 
 
 		 608 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17041  ribonuclease E/G  61.89 
 
 		 606 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1593  ribonuclease  58.01 
 
 		 605 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.435522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  41.77 
 
 		 559 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  39.69 
 
 		 564 aa  309  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  40.71 
 
 		 702 aa  299  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  40.68 
 
 		 1041 aa  296  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  37.29 
 
 		 494 aa  293  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  39.35 
 
 		 1007 aa  289  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  39.09 
 
 		 1093 aa  288  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  39.61 
 
 		 908 aa  288  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  40.86 
 
 		 571 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  39.67 
 
 		 543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.05 
 
 		 562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  40.51 
 
 		 1080 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  36.83 
 
 		 1194 aa  284  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  40.45 
 
 		 1123 aa  282  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  39.35 
 
 		 1040 aa  282  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.41 
 
 		 416 aa  281  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1200  ribonuclease, Rne/Rng family  41.87 
 
 		 496 aa  281  5e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  35.82 
 
 		 1427 aa  280  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  36.28 
 
 		 1334 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  36.71 
 
 		 922 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  38.89 
 
 		 990 aa  277  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  35.59 
 
 		 1043 aa  276  9e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  38.28 
 
 		 411 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  35.96 
 
 		 1113 aa  275  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  36.23 
 
 		 1151 aa  274  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  35.2 
 
 		 1117 aa  274  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  34.12 
 
 		 944 aa  274  6e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  36.88 
 
 		 1048 aa  273  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  35.87 
 
 		 476 aa  273  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  39.02 
 
 		 952 aa  271  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  43.08 
 
 		 496 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  37.56 
 
 		 1058 aa  270  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  42.82 
 
 		 496 aa  270  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  41.16 
 
 		 531 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  42.07 
 
 		 503 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  35.19 
 
 		 974 aa  269  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  38.16 
 
 		 1024 aa  268  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  38.31 
 
 		 961 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  39.52 
 
 		 483 aa  267  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  36.23 
 
 		 1022 aa  267  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  39.35 
 
 		 717 aa  265  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  35.04 
 
 		 1265 aa  266  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  37.44 
 
 		 1016 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  38.4 
 
 		 1070 aa  265  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  39.39 
 
 		 959 aa  264  4.999999999999999e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  37.04 
 
 		 991 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  37.04 
 
 		 991 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  37.04 
 
 		 987 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  37.73 
 
 		 1093 aa  262  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  37.99 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  37.99 
 
 		 496 aa  261  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  37.09 
 
 		 515 aa  259  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  39.28 
 
 		 636 aa  259  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_002620  TC0193  ribonuclease G  38.21 
 
 		 512 aa  258  4e-67  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0692985  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  39.39 
 
 		 497 aa  258  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  35.59 
 
 		 1018 aa  257  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  40.28 
 
 		 503 aa  257  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  39.14 
 
 		 497 aa  257  7e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0293  ribonuclease  34.76 
 
 		 525 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806151 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  38.86 
 
 		 489 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  36.45 
 
 		 953 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  36.78 
 
 		 1091 aa  256  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  39.32 
 
 		 490 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  38.24 
 
 		 489 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  41.51 
 
 		 500 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  38.24 
 
 		 489 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  40.1 
 
 		 492 aa  253  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  36.97 
 
 		 497 aa  253  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  37.63 
 
 		 1244 aa  253  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1375  ribonuclease  35.9 
 
 		 483 aa  252  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14130  ribonuclease, Rne/Rng family  36.64 
 
 		 489 aa  251  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000124696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  40.41 
 
 		 493 aa  250  7e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  38.82 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1764  ribonuclease  35.6 
 
 		 465 aa  249  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  39.38 
 
 		 491 aa  248  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  36.82 
 
 		 528 aa  247  6e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3013  ribonuclease  35.44 
 
 		 866 aa  247  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000305018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4433  ribonuclease, Rne/Rng family  36.36 
 
 		 520 aa  246  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.320456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  36.82 
 
 		 528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  37.13 
 
 		 508 aa  245  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  38.11 
 
 		 530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  40.99 
 
 		 489 aa  244  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  39.26 
 
 		 474 aa  244  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  38.21 
 
 		 515 aa  243  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>