25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00819 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  100 
 
 
823 aa  1681    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  41.9 
 
 
2848 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  40.88 
 
 
1480 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  34.93 
 
 
1362 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  54.31 
 
 
972 aa  93.2  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  39.29 
 
 
483 aa  61.2  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.17 
 
 
440 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.05 
 
 
1987 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  41.41 
 
 
852 aa  60.1  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  37.44 
 
 
14609 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.82 
 
 
456 aa  55.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  36.29 
 
 
780 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  46.15 
 
 
968 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.67 
 
 
1831 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 
727 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.75 
 
 
3278 aa  48.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6059  Thrombospondin type 3 repeat protein  35.94 
 
 
292 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 
487 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  34.51 
 
 
386 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  29.27 
 
 
843 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  32.52 
 
 
792 aa  45.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  32.89 
 
 
374 aa  44.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  41.67 
 
 
772 aa  44.7  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.61 
 
 
1707 aa  44.3  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>