44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf462 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  100 
 
 
228 aa  375  1e-103  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  59.6 
 
 
848 aa  157  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  54.61 
 
 
497 aa  129  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  58.65 
 
 
623 aa  109  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4569  hypothetical protein  54.92 
 
 
495 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0942693  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0629  lipoprotein (VmcE)  30.5 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0157235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  50.62 
 
 
3521 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf220  hypothetical lipoprotein  52.81 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000054375  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  50.71 
 
 
3472 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  50.71 
 
 
3471 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0559  trans-sialidase  56.63 
 
 
331 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  41.44 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf223  hypothetical lipoprotein  68.29 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000105569  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf486  hypothetical lipoprotein  54.55 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542725  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1160  hypothetical protein  46.39 
 
 
566 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0788241  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0558  hypothetical protein  50.6 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.362885 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1258  hypothetical protein  41.35 
 
 
355 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf316  hypothetical lipoprotein  75 
 
 
154 aa  53.1  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000763902  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf566  hypothetical lipoprotein  81.82 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000987046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1151  hypothetical protein  40.82 
 
 
350 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf224  hypothetical lipoprotein  80 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378755  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.67 
 
 
267 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3628  hypothetical protein  41.35 
 
 
331 aa  51.6  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1806  hypothetical protein  27.65 
 
 
685 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0181  hypothetical protein  32.14 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198242  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5164  hypothetical protein  26.88 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.830633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1204  hypothetical protein  28.93 
 
 
1116 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115065  normal  0.894355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1372  hypothetical protein  42.22 
 
 
344 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4250  FHA domain-containing protein  33.72 
 
 
547 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.596037  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf221  hypothetical lipoprotein  52.54 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000001977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  29.12 
 
 
670 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  52.83 
 
 
441 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf227  hypothetical lipoprotein  50 
 
 
286 aa  47  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.25 
 
 
266 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf229  hypothetical lipoprotein  59.38 
 
 
316 aa  46.2  0.0004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  48.08 
 
 
3409 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf584  virulence-associated lipoprotein MIA  63.79 
 
 
255 aa  45.4  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0652484  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf459  hypothetical membrane protein  47.83 
 
 
139 aa  45.4  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000144651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6740  hypothetical protein  48.28 
 
 
406 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466169  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.17 
 
 
775 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  35.23 
 
 
542 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8091  hypothetical protein  26.26 
 
 
450 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.623212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  39.74 
 
 
867 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1324  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  45.61 
 
 
492 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>