23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3514 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3514  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 267 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1945  peptidoglycan binding domain-containing protein  72.53 
 
 		 266 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0459891  normal  0.0921332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2064  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  61.25 
 
 		 233 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1780  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.04 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0189708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2622  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.75 
 
 		 201 aa  185  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3046  hypothetical protein  43.21 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2220  hypothetical protein  46.69 
 
 		 193 aa  161  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0699  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.16 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0710  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.47 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.296001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4662  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.47 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.486604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1122  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.843879 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf462  hypothetical lipoprotein  31.67 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000141923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0713  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.68 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1638  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.322514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1669  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.46 
 
 		 228 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  52.94 
 
 		 462 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  52.94 
 
 		 413 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  49.02 
 
 		 411 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  35.48 
 
 		 410 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1306  hypothetical protein  37.74 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.340844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  37.29 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2682  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.29 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>