102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0917 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  100 
 
 
431 aa  887    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  53.07 
 
 
413 aa  418  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.59 
 
 
404 aa  336  5e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410538  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  39.62 
 
 
415 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.01 
 
 
414 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.69 
 
 
642 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  36.48 
 
 
437 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.17 
 
 
374 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.63 
 
 
499 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.71 
 
 
375 aa  171  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
409 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
442 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.92 
 
 
304 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.46 
 
 
429 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  33.71 
 
 
322 aa  112  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.7 
 
 
365 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  31.19 
 
 
321 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.79 
 
 
822 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  31.29 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  31.29 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000355062  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  31.18 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000017161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  28 
 
 
466 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  90.1  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  29.39 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1753  hypothetical protein  32.04 
 
 
271 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  27.97 
 
 
344 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  27.39 
 
 
545 aa  53.9  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3509  hypothetical protein  30.58 
 
 
171 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
171 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
393 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
625 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.85 
 
 
175 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.54 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4058  hypothetical protein  30.77 
 
 
445 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.45 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3600  protein of unknown function DUF949  36.45 
 
 
409 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.65 
 
 
244 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4119  protein of unknown function DUF949  27.41 
 
 
355 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  28.46 
 
 
166 aa  50.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2998  hypothetical protein  30.15 
 
 
175 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1859  hypothetical protein  27.36 
 
 
504 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.286252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1094  protein of unknown function DUF949  26.23 
 
 
357 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0542977  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3060  hypothetical protein  30.56 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  32.26 
 
 
186 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  33.06 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.06 
 
 
188 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.92 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3597  hypothetical protein  28.1 
 
 
171 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0935961  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3169  protein of unknown function DUF949  28.12 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2912  hypothetical protein  29.41 
 
 
175 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0905  hypothetical protein  30.48 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.25 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.89 
 
 
179 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1955  putative lipoprotein  31.43 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  33.8 
 
 
184 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0391  hypothetical protein  35.96 
 
 
492 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.672589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.06 
 
 
171 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2033  putative lipoprotein  31.43 
 
 
403 aa  47  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34888  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  32.58 
 
 
345 aa  47  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.45 
 
 
171 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5898  hypothetical protein  26.75 
 
 
378 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.494834  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.7 
 
 
190 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2123  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.59 
 
 
219 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  31.19 
 
 
171 aa  46.6  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.82 
 
 
249 aa  46.6  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  33.54 
 
 
184 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  33.54 
 
 
184 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0734  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.63 
 
 
244 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.69 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0527  hypothetical protein  35.96 
 
 
477 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2569  hypothetical protein  27.7 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  27.78 
 
 
256 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.26 
 
 
633 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  27.1 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.86 
 
 
181 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.19 
 
 
194 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1211  2-dehydro-3-deoxyphosphooctonate aldolase  31.52 
 
 
238 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  29.28 
 
 
184 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0510  protein of unknown function DUF949  32.58 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0531  hypothetical protein  32.58 
 
 
485 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4116  hypothetical protein  25.53 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.547792  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5308  hypothetical protein  25.64 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0542  hypothetical protein  27.27 
 
 
407 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
244 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.58 
 
 
171 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.2 
 
 
241 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  32.58 
 
 
494 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4794  hypothetical protein  24.71 
 
 
518 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594922  hitchhiker  0.00337407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4193  hypothetical protein  25.69 
 
 
364 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.939474  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0298  hypothetical protein  32.58 
 
 
487 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.187511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>