More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1509 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
341 aa  701    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
1276 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 
3560 aa  86.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.82 
 
 
1694 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
927 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 
3035 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  31.4 
 
 
743 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.79 
 
 
810 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.37 
 
 
623 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.26 
 
 
730 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
878 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 
836 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.46 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.61 
 
 
1007 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
1192 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
523 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
699 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.92 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1276 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
1094 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.57 
 
 
764 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
716 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 
784 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.94 
 
 
1979 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 
543 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
562 aa  73.6  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.1 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.91 
 
 
725 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  23.6 
 
 
715 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
523 aa  73.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 
1022 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
452 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
1827 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  30.53 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.12 
 
 
622 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  35.78 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  28.08 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  26.28 
 
 
564 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
713 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
4079 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  29.14 
 
 
745 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30 
 
 
462 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
685 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.14 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.94 
 
 
573 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
761 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 
202 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
1121 aa  67  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 
968 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.15 
 
 
296 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 
162 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
1056 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 
1056 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 
576 aa  66.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1421 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
4489 aa  66.2  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
3145 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  31.25 
 
 
577 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
711 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
512 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21931  hypothetical protein  26.67 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
750 aa  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.21 
 
 
292 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 
196 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.104926  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.48 
 
 
707 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
602 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.73 
 
 
818 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 
515 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2545  tetratricopeptide domain-containing protein  32.69 
 
 
672 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216986  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.93 
 
 
587 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
217 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
416 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
200 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.69 
 
 
816 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 
1297 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
636 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  37.62 
 
 
634 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
406 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
3172 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
670 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>