125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1207 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  100 
 
 
267 aa  523  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  88.33 
 
 
251 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  79.78 
 
 
242 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  89.14 
 
 
263 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  89.14 
 
 
263 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  89.14 
 
 
263 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  88.76 
 
 
276 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  88.76 
 
 
279 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  76.26 
 
 
273 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  74.34 
 
 
265 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  73.58 
 
 
265 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  73.13 
 
 
268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  73.13 
 
 
268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  73.13 
 
 
268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  74.26 
 
 
272 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  57.19 
 
 
276 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  57.04 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  56.37 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  66.95 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  67.8 
 
 
218 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  66.1 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  59.84 
 
 
207 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  63.3 
 
 
258 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  58.06 
 
 
185 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.75 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.74 
 
 
185 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  47.26 
 
 
193 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  43.94 
 
 
228 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  44.59 
 
 
183 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  45.45 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  49.61 
 
 
170 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.23 
 
 
182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  47.29 
 
 
186 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.43 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  47.46 
 
 
170 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  45.61 
 
 
183 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.74 
 
 
183 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  48.6 
 
 
135 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  40.74 
 
 
131 aa  92.4  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  38.14 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  43.56 
 
 
160 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  37.9 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.77 
 
 
164 aa  86.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  42.86 
 
 
171 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.32 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.32 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.32 
 
 
192 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  46.43 
 
 
172 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  28.32 
 
 
177 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  27.75 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.93 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  40.71 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.09 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.32 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  35.04 
 
 
143 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.75 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.75 
 
 
174 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  44.05 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  44.05 
 
 
173 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  32.52 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  43.04 
 
 
173 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  39.32 
 
 
161 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  42.86 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  25.86 
 
 
167 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  42.86 
 
 
176 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  32.77 
 
 
163 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  37.84 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  31.09 
 
 
164 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  35.87 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.87 
 
 
130 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.25 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  33.87 
 
 
131 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.03 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.76 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  31.54 
 
 
178 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.57 
 
 
171 aa  72  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.1 
 
 
178 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  38.78 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.95 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  37.63 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  43.75 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  33.94 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  30.08 
 
 
118 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  46.67 
 
 
117 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  31.25 
 
 
130 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 
117 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0437  hypothetical protein  34.69 
 
 
104 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0413  hypothetical protein  34.69 
 
 
104 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  33.01 
 
 
119 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  40.43 
 
 
128 aa  63.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1406  SmpA/OmlA  40.74 
 
 
117 aa  62.4  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  33.01 
 
 
119 aa  62  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.96 
 
 
110 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  35.83 
 
 
113 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>