127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1593 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  100 
 
 
130 aa  270  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  77.86 
 
 
131 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  61.82 
 
 
130 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  61.82 
 
 
130 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  40.66 
 
 
258 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  40.38 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  34.4 
 
 
276 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  32 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  33.63 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  36.26 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  38.68 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.86 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.54 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.56 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.56 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.62 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  34.86 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.77 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.54 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  37.63 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  40.51 
 
 
272 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  33.68 
 
 
175 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  36.54 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  33.68 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.74 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  34.31 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  37.36 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  37.36 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  31.58 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.73 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.36 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.36 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  32.63 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  36.17 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.36 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.36 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  37.36 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  37.97 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  37.97 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.97 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.97 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  32.61 
 
 
218 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.98 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.82 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  29.09 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  32.17 
 
 
281 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  31.25 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.44 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.16 
 
 
273 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.44 
 
 
265 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  37.86 
 
 
342 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  31.52 
 
 
218 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  35.48 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  35.48 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.44 
 
 
105 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  34.18 
 
 
219 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  36.05 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  32.35 
 
 
163 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.84 
 
 
178 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  34.78 
 
 
178 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.78 
 
 
178 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  31.19 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  36.05 
 
 
187 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.07 
 
 
183 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  36.7 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.7 
 
 
178 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  34.69 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  28.87 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  31.91 
 
 
117 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  39.19 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  30.77 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.02 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  32.17 
 
 
183 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  36.73 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  34.23 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  35.64 
 
 
113 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.31 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  37.5 
 
 
120 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  32.08 
 
 
177 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 
192 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.32 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  35.64 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  37.65 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  35.64 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  35.64 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  35.64 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  35.64 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.73 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>