130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0264 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  100 
 
 		 138 aa  286  8e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  94.93 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  57.63 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  35.14 
 
 		 171 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  36.04 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  38.14 
 
 		 196 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  36.08 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.08 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.05 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  40.48 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  41.46 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  40.48 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.11 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.14 
 
 		 174 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  34.29 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.04 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  36.17 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  34.94 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  34.21 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  34.94 
 
 		 177 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 192 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 192 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 164 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.94 
 
 		 192 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  36.17 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  34.58 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  33.73 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  39.36 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  31.78 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  38.75 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  32.76 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  41.89 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  31.31 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  28.69 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  30.3 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  29.25 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  32.23 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  36.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  36.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  36.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  36.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  36.19 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  31.9 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  31.9 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  38.37 
 
 		 342 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.91 
 
 		 171 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  39.34 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  29.92 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  42.37 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  43.84 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  32.32 
 
 		 281 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  34.55 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.2 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  34.62 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  34.31 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  38.27 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  28.7 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  34.69 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  32.38 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  30.17 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.04 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  34.34 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  30.17 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.83 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  29.01 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.65 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  30.43 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  28.45 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.24 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  31.68 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.68 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.1 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  29.41 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1517  outer membrane protein  34.38 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  30.69 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1460  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.38 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.708366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  35.71 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  35.44 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  35.29 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  35.29 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  35.29 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1406  SmpA/OmlA  36.05 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  35.29 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  28.43 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  26.92 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  35.29 
 
 		 263 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>