128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2385 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2385  small protein A  100 
 
 		 163 aa  337  5.9999999999999996e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  79.74 
 
 		 163 aa  263  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  79.08 
 
 		 174 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  79.08 
 
 		 174 aa  261  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  78.43 
 
 		 174 aa  260  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  77.12 
 
 		 177 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  77.12 
 
 		 192 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  77.12 
 
 		 192 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  77.12 
 
 		 192 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  76.1 
 
 		 174 aa  259  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  74.85 
 
 		 167 aa  254  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  73.86 
 
 		 167 aa  250  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  74.38 
 
 		 164 aa  249  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  74.51 
 
 		 164 aa  249  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  72.12 
 
 		 182 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  69.59 
 
 		 171 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  52.14 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  41.3 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  45.87 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  42.37 
 
 		 118 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  41.41 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  43.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  38.24 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  40.82 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  41.28 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  46.91 
 
 		 112 aa  84.3  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  38.78 
 
 		 113 aa  84.3  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02271  SmpA/OmlA family protein  54.17 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  41.67 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  38.95 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  38.95 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  40.86 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  38.32 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  40.82 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  35 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  34.09 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  40.74 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  39.81 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  35.58 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  36.04 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  35.14 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  34.62 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  40.7 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  36.89 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  31.65 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  36.04 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.96 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.86 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  33.07 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  39.08 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  35.24 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.96 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.96 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  34.29 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  35.14 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.46 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  32.08 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  29.66 
 
 		 288 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.41 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  34.41 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  39.53 
 
 		 117 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  30 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  32.38 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  37.93 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  32.08 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.04 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.79 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  28.57 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.08 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  32.68 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  27.97 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  30.48 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  30.48 
 
 		 276 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  30.48 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  36.27 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  37.5 
 
 		 281 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  37.38 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  30.48 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  30.48 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  30.48 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.19 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  31.37 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>