93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02271 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02271  SmpA/OmlA family protein  100 
 
 		 73 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  75 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  57.53 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  54.79 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.05 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.05 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  56.94 
 
 		 164 aa  87  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.05 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  52.05 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  54.79 
 
 		 167 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.68 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.78 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.68 
 
 		 192 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.68 
 
 		 192 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.68 
 
 		 192 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  50.68 
 
 		 177 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  52.7 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  54.17 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  41.67 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  41.27 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  46.67 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  41.18 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  38.33 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  39.71 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.1 
 
 		 178 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.1 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  38.24 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  36.76 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.48 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  35.48 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  36.99 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  41.38 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  35.48 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  39.29 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.38 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.48 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  35.48 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  41.67 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  35.48 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  36.21 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 268 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  32.26 
 
 		 233 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  47.22 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  47.22 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  35 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.84 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  33.87 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  30.77 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  31.94 
 
 		 267 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  48.48 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.94 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.94 
 
 		 242 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  31.94 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.94 
 
 		 279 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  31.94 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.94 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  31.94 
 
 		 263 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.56 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.56 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  34.48 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  32.26 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  51.52 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  37.84 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.94 
 
 		 273 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  35.21 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  32.31 
 
 		 185 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.33 
 
 		 105 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  32.26 
 
 		 187 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.92 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  32.31 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  32.84 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  29.03 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  32.84 
 
 		 207 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.79 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  30.56 
 
 		 272 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.03 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>