130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2890 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  238  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  99.12 
 
 		 113 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  99.12 
 
 		 113 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  86.49 
 
 		 112 aa  204  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  79.28 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  79.28 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  79.28 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  79.28 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  79.28 
 
 		 112 aa  193  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  79.28 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  77.88 
 
 		 113 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  76.99 
 
 		 113 aa  190  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  76.11 
 
 		 113 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  77.27 
 
 		 111 aa  173  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  72.07 
 
 		 114 aa  173  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  77.27 
 
 		 111 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  72.07 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  45.74 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  45.54 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  43.27 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  41.9 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0566  small protein A  39.39 
 
 		 110 aa  88.6  2e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.183668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02505  small membrane lipoprotein  76 
 
 		 50 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  38.78 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.71 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.45 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  40 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  37.63 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.63 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.63 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.63 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  33.68 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  39.77 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.77 
 
 		 192 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  37.78 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  35.58 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.48 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  40.59 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  37.61 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  40 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  34.69 
 
 		 233 aa  72  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.96 
 
 		 171 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  35.79 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  34.74 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.96 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  37.5 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  44 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  32.76 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  35.4 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  35.96 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.13 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  30.7 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  31.07 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  32.76 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  37.38 
 
 		 218 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.38 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  30.84 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  43.06 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  32.38 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  38.1 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1391  outer membrane lipoprotein  33.65 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000387468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  34.44 
 
 		 178 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  32.38 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  28.04 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.44 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.44 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  28.04 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.44 
 
 		 172 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  36.27 
 
 		 190 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  33.33 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.91 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  31.78 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  35.8 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.82 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  31.52 
 
 		 281 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.78 
 
 		 265 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.78 
 
 		 265 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.29 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  33.66 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  34.69 
 
 		 288 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  32.04 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  33.33 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  35.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.43 
 
 		 199 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.96 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  30.36 
 
 		 228 aa  53.5  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  34.78 
 
 		 272 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  33.65 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  36 
 
 		 249 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>