128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1713 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1713  SmpA/OmlA  100 
 
 		 118 aa  246  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2773  SmpA/OmlA domain-containing protein  53.85 
 
 		 174 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664934  normal  0.104565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2851  SmpA/OmlA domain-containing protein  53.85 
 
 		 174 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1476  small protein A  53.85 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.14 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  52.99 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  46.22 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.86 
 
 		 167 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1310  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.43 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1301  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.43 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.84513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1337  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.43 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3049  SmpA/OmlA domain protein  50.43 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.331273  normal  0.468309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  52.14 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  50.83 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  49.17 
 
 		 167 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1271  SmpA/OmlA domain-containing protein  57.58 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.175523  normal  0.212441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02271  SmpA/OmlA family protein  75 
 
 		 73 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1410  SmpA/OmlA domain-containing protein  55.56 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1242  SmpA/OmlA  45.69 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.834375  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  38.89 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  36.94 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  35.9 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3097  hypothetical protein  42.68 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.525418  normal  0.376087 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  38.83 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  36.04 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2880  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2830  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.015187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2900  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.748981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2898  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3012  hypothetical protein  40.24 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  35.45 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.78 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  36.94 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  31.73 
 
 		 281 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.32 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  37.04 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  34.74 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0727  hypothetical protein  40.26 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.405452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0962  hypothetical protein  40.26 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.719201  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  35.48 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  34.78 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  36.17 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  36.17 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.78 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.78 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.58 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  39.13 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  34.74 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  39.51 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.41 
 
 		 172 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  32.63 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  38.89 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  31.45 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  34.95 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  29.7 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  30.69 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  34.95 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  35 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  36.67 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 268 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  36.36 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  29.25 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  34.44 
 
 		 251 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.44 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.67 
 
 		 273 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  34.44 
 
 		 276 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.44 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.44 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.44 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  34.44 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  40.96 
 
 		 342 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  34.44 
 
 		 267 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  35.56 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  26.83 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  36.36 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  30.36 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  31.48 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  32.94 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  31.37 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  32.94 
 
 		 187 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  35.23 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  33.71 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  34.83 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  25.41 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  32.41 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>