123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1406 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1406  SmpA/OmlA  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6008  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.38 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3098  SmpA/OmlA  40.51 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0701  SmpA/OmlA domain-containing protein  41.24 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410018  hitchhiker  0.0000863527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0759  SmpA/OmlA  40.45 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3923  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.7 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0475  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.08 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4509  outer membrane lipoprotein OmlA  45.31 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0935  SmpA/OmlA  33.33 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.970773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4554  SmpA/OmlA domain-containing protein  38.75 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4731  SmpA/OmlA domain protein  49.15 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4199  SmpA/OmlA  45.31 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4597  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.48 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4732  SmpA/OmlA domain-containing protein  49.15 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43020  outer membrane lipoprotein OmlA  35.96 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3271  SmpA/OmlA domain protein  39.53 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0222  small protein A (tmRNA-binding)-like protein  35.64 
 
 		 183 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0457  SmpA/OmlA domain protein  35.79 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0279  lipoprotein, SmpA/OmlA family  35.79 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1886  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.11 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3968  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.58 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1654  SmpA/OmlA  39.02 
 
 		 185 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3628  SmpA/OmlA domain-containing protein  44.44 
 
 		 172 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0407  SmpA/OmlA domain protein  32.74 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0476  SmpA/OmlA  42.65 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3456  outer membrane lipoprotein, putatitve  34.65 
 
 		 251 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0374  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.51 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1207  outer membrane lipoprotein, putatitve  40.74 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.87413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2457  outer membrane lipoprotein, putatitve  39.51 
 
 		 276 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1233  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.51 
 
 		 279 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0167  SmpA/OmlA  40.79 
 
 		 268 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0650  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.79 
 
 		 268 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0617  SmpA/OmlA domain-containing protein  40.79 
 
 		 268 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1728  SmpA/OmlA domain protein  37.66 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2737  small protein A (tmRNA-binding)-like  37.18 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000974363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1069  SmpA/OmlA domain-containing protein  30.84 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3419  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.51 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3454  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.51 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2644  SmpA/OmlA family lipoprotein  39.51 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3826  SmpA/OmlA family protein  34.04 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0264  outer membrane lipoprotein OmlA  36.67 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.28381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0572  putative outer membrane lipoprotein  41.33 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0290  SmpA/OmlA  31.13 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0676323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1906  SmpA/OmlA domain-containing protein  31.73 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0545  SmpA/OmlA domain-containing protein  39.51 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0571  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.46 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.253801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1124  hypothetical protein  38.89 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2592  SmpA/OmlA domain-containing protein  36.9 
 
 		 297 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0754  SmpA/OmlA  40.48 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2736  SmpA/OmlA domain-containing protein  35.42 
 
 		 273 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3384  SmpA/OmlA domain protein  40 
 
 		 276 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148479 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0776  SmpA/OmlA  34.44 
 
 		 281 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.880566  hitchhiker  0.000137115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2836  SmpA/OmlA  38.67 
 
 		 207 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2051  SmpA/OmlA domain protein  30.91 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2622  small protein A  32.35 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0230  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.41 
 
 		 249 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4609  SmpA/OmlA  36.62 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3790  SmpA/OmlA domain-containing protein  37.14 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0377  small protein A  32.35 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3736  outer membrane lipoprotein, SmpA/OmlA  38.16 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0966  outer membrane lipoprotein  35.42 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63030  outer membrane lipoprotein OmlA precursor  44.64 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2985  SmpA/OmlA domain protein  37.04 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2746  putative lipoprotein transmembrane  35.8 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2575  SmpA/OmlA domain protein  35.8 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5485  outer membrane lipoprotein OmlA  44.64 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01128  hypothetical protein  30.11 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0252  SmpA/OmlA domain protein  29.2 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3366  SmpA/OmlA domain-containing protein  32.18 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0061494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2975  SmpA/OmlA  43.4 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.977187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1195  SmpA/OmlA  35.62 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2476  lipoprotein, small protein A  31.87 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004297  lipoprotein SmpA a component of the essential YaeT outer-membrane protein assembly complex  31.91 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1482  SmpA/OmlA domain-containing protein  27.93 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01180  outer membrane protein  31.63 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1285  SmpA/OmlA domain-containing protein  29.59 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.522478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3687  hypothetical protein  32.41 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0028904  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1097  SmpA/OmlA domain-containing protein  29.13 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1523  SmpA/OmlA domain-containing protein  28.57 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.512522  hitchhiker  0.00464967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2890  hypothetical protein  33.66 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000014061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1375  hypothetical protein  33.66 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000233732  normal  0.0312807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2977  hypothetical protein  33.66 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1593  SmpA/OmlA domain protein  29.67 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3219  hypothetical protein  35.96 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0986  SmpA/OmlA domain protein  37.5 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2385  small protein A  31.07 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.750326  normal  0.621044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1058  SmpA/OmlA domain protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.276511  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3857  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00570631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0227  small protein A  30.59 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6244  OmpA/MotB domain-containing protein  36.59 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.768223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02469  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.10509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1232  SmpA/OmlA domain-containing protein  34.57 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2775  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494062  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2901  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.301484  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1067  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261293  normal  0.540177 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2769  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0179366  normal  0.124588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3006  hypothetical protein  30.3 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00281492  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2949  SmpA/OmlA domain-containing protein  33.33 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1605  Outer membrane lipoprotein OmlA  31 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.730668  normal  0.548797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>