More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3548 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3548  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.385244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3549  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  41.11 
 
 
1764 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
201 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
878 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
804 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 
810 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 
2240 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.22 
 
 
833 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  25.13 
 
 
1213 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 
649 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2701  FecR protein  28.08 
 
 
1237 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0375839  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
808 aa  59.7  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
219 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
927 aa  59.3  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
280 aa  59.3  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
534 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  24.04 
 
 
219 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  24.04 
 
 
219 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.55 
 
 
1676 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.33 
 
 
745 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  25.45 
 
 
269 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.75 
 
 
594 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 
632 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.54 
 
 
820 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 
200 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  24.04 
 
 
219 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
750 aa  57.4  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  27.51 
 
 
729 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  24.14 
 
 
219 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
219 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 
499 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  24.14 
 
 
219 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
1827 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
199 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
249 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 
265 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 
201 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
265 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 
222 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 
792 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
605 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 
1056 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.65 
 
 
837 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
3145 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  26.64 
 
 
544 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.45 
 
 
795 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
224 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
634 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  28.85 
 
 
399 aa  53.9  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 
1406 aa  53.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 
767 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
1022 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  34.95 
 
 
266 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
375 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
409 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
465 aa  53.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
258 aa  52.8  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2921  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
190 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
1737 aa  52.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 
227 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 
265 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2370  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 
1272 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0364694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
612 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 
376 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 
750 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.84 
 
 
1056 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
191 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.52 
 
 
988 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 
957 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  32.48 
 
 
704 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 
220 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
824 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.43 
 
 
603 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.82 
 
 
733 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.32 
 
 
452 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.77 
 
 
725 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
818 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  27.91 
 
 
979 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  27.52 
 
 
832 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  25.69 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  20.78 
 
 
676 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  26.13 
 
 
695 aa  50.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 
620 aa  50.8  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 
553 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
421 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  20.59 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>