53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2282 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2282  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 354 aa  740    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.989795  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1751  hypothetical protein  26.29 
 
 		 232 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.476449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 421 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  31.31 
 
 		 708 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 605 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 4079 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 635 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 635 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00983  hypothetical protein  26.49 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 1737 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 685 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 909 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 790 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.34 
 
 		 689 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 611 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 739 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.28 
 
 		 742 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 592 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.26 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1952  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000386377  hitchhiker  0.0018438 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.87 
 
 		 2240 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 790 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 681 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 847 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 708 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.42 
 
 		 725 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 637 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 620 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.98 
 
 		 810 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  26.47 
 
 		 703 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.22 
 
 		 739 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1156  putative esterase  32.54 
 
 		 302 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796997  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 265 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.94 
 
 		 882 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.57 
 
 		 535 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 216 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 636 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.91 
 
 		 816 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3314  fimbrial biogenesis and twitching motility protein, putative  27.13 
 
 		 262 aa  43.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 639 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1371  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.503899  normal  0.0591536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3150  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0633925  hitchhiker  0.00734203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 762 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3007  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000355185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2992  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.91 
 
 		 262 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00509234  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 637 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>