99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3631 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3631  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  100 
 
 
480 aa  1013    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000140973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  47.91 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0701  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  42.79 
 
 
427 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1521  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.77 
 
 
416 aa  335  9e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1101  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  41.15 
 
 
488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4608  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  39.32 
 
 
492 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1820  cytochrome c552  41.72 
 
 
498 aa  326  6e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1980  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  39.06 
 
 
476 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0955  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  42.14 
 
 
489 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0964  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  41.5 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142807  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2866  cytochrome c nitrite reductase  41.04 
 
 
478 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0960  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  41.85 
 
 
490 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1892  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  41.33 
 
 
469 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000066915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0910  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  41.35 
 
 
490 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0963  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  41.6 
 
 
490 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2333  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.76 
 
 
524 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1490  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.97 
 
 
529 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2398  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  38.28 
 
 
496 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2097  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.44 
 
 
520 aa  276  6e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1374  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  36.34 
 
 
536 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1359  cytochrome c552  36.55 
 
 
610 aa  272  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2385  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35.2 
 
 
524 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0081  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.84 
 
 
527 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.304883  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1244  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35.22 
 
 
607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1546  cytochrome c552  35.94 
 
 
610 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.421407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0648  cytochrome c552  36.64 
 
 
467 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0169797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2902  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  33.27 
 
 
556 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0151335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0341  cytochrome c552  35.73 
 
 
610 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0605023  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0294  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  37.38 
 
 
488 aa  268  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000431436  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0622  cytochrome c552  39.34 
 
 
463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0844  cytochrome c552  39.34 
 
 
466 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000415815  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0972  cytochrome c552  36.38 
 
 
466 aa  266  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0931  cytochrome c552  39.06 
 
 
466 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000109321  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3092  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.7 
 
 
557 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0831  cytochrome c552  39.06 
 
 
467 aa  262  8e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.01441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0659  cytochrome c552  35.95 
 
 
473 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000892238  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3363  cytochrome c552  35.95 
 
 
473 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.328864  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0665  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35.52 
 
 
484 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00225794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0658  cytochrome c552  35.95 
 
 
473 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.034848  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3652  cytochrome c552  36.38 
 
 
467 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00563536  hitchhiker  0.0000468517 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02727  cytochrome c552  36.73 
 
 
469 aa  260  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2987  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.33 
 
 
557 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0685  cytochrome c552  36.38 
 
 
467 aa  260  4e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000162376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0794  cytochrome c552  36.38 
 
 
467 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00711776  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1024  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA  35.03 
 
 
605 aa  259  6e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140418  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3711  cytochrome c552  36.16 
 
 
467 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000131094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3834  cytochrome c552  36.16 
 
 
467 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  normal  0.0322806 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1997  cytochrome c552  34.23 
 
 
478 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003114  cytochrome c552 precursor  35.66 
 
 
475 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3980  cytochrome c552  35.84 
 
 
467 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0707  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.84 
 
 
515 aa  257  4e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000210974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0211  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.03 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000324038  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0529  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.16 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2812  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.83 
 
 
466 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1042  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35.75 
 
 
482 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0722076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1200  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  36.53 
 
 
487 aa  251  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.849928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3154  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA, putative  35.82 
 
 
490 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3705  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35 
 
 
513 aa  249  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0129  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.11 
 
 
557 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4671  cytochrome c552  34.07 
 
 
478 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2432  cytochrome c552  35.44 
 
 
477 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4536  cytochrome c552  34.07 
 
 
478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4529  cytochrome c552  34.07 
 
 
478 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4622  cytochrome c552  33.83 
 
 
478 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4620  cytochrome c552  33.83 
 
 
478 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  0.388303 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2735  cytochrome c552  33.78 
 
 
472 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4315  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  237  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03902  hypothetical protein  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5575  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3922  formate-dependent cytochrome c nitrite reductase, c552 subunit  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03942  nitrite reductase, formate-dependent, cytochrome  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4626  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3957  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4591  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4532  cytochrome c552  33.41 
 
 
478 aa  236  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2929  cytochrome c552  33.49 
 
 
483 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1296  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.73 
 
 
483 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000757773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0296  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  32.89 
 
 
485 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000171973  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2150  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.81 
 
 
492 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2070  cytochrome c552  32.74 
 
 
492 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2586  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.78 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00414644  normal  0.0377964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3036  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.42 
 
 
469 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3604  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.69 
 
 
469 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.357303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0688  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.67 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0505  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.7 
 
 
452 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2363  cytochrome c552  32.94 
 
 
477 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000178461  hitchhiker  0.000909202 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1228  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.9 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3653  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.64 
 
 
517 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3744  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.3 
 
 
573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08100  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  29.22 
 
 
485 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  hitchhiker  0.0000000773325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4004  formate-dependent nitrite reductase periplasmic cytochrome c552 subunit-like protein  28.51 
 
 
536 aa  147  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00066664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13420  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  27.74 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1061  cytochrome c family protein  27.56 
 
 
541 aa  140  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.409799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1277  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.13 
 
 
538 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0357  cytochrome c family protein  28.1 
 
 
533 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412865  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2946  cytochrome c family protein  27.56 
 
 
538 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2999  cytochrome c family protein  26.56 
 
 
534 aa  126  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00460  hypothetical protein  26.37 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  26.35 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>