21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1198 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1198  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  872    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  57.14 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  56.17 
 
 		 418 aa  498  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  53.41 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  52.63 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  51.08 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  21.73 
 
 		 790 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  22.51 
 
 		 620 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  27.78 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 625 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3137  cytochrome c family protein  24.69 
 
 		 591 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0170  cytochrome c family protein  23.38 
 
 		 596 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  27.13 
 
 		 656 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  24.83 
 
 		 652 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  24.83 
 
 		 650 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  25.1 
 
 		 620 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.1 
 
 		 806 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  24.24 
 
 		 620 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  23.66 
 
 		 626 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  22.91 
 
 		 657 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>