46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2663 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  100 
 
 		 638 aa  1246    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  40.04 
 
 		 807 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  38.92 
 
 		 819 aa  286  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 676 aa  286  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  35.57 
 
 		 821 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  38.36 
 
 		 817 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  34.98 
 
 		 811 aa  276  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  35.16 
 
 		 851 aa  267  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  34.92 
 
 		 818 aa  261  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  35.66 
 
 		 820 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  36.3 
 
 		 837 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  34.32 
 
 		 1209 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  34.17 
 
 		 1209 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  35.69 
 
 		 840 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  33.69 
 
 		 838 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  33.24 
 
 		 829 aa  240  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  33.73 
 
 		 837 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  33.77 
 
 		 829 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  35.33 
 
 		 878 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  31.91 
 
 		 826 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  32.35 
 
 		 826 aa  234  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  33.24 
 
 		 829 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.81 
 
 		 1237 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.5 
 
 		 1224 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.17 
 
 		 1224 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.17 
 
 		 1224 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  35.09 
 
 		 851 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  34.55 
 
 		 843 aa  219  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  33.58 
 
 		 835 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  33.94 
 
 		 836 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  37.7 
 
 		 476 aa  206  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  34.15 
 
 		 834 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  33.54 
 
 		 836 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  34.12 
 
 		 830 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  37.5 
 
 		 651 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  30.63 
 
 		 851 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  38.91 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  34.13 
 
 		 638 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  35.05 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  38.36 
 
 		 948 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  36 
 
 		 948 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  31.45 
 
 		 951 aa  53.9  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  31.43 
 
 		 614 aa  48.9  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  31.59 
 
 		 1976 aa  48.5  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  31.06 
 
 		 2795 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  29.69 
 
 		 4672 aa  45.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>