39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0592 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  73.25 
 
 
829 aa  1216    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  68.79 
 
 
834 aa  1089    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  83.1 
 
 
837 aa  1400    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  74.32 
 
 
829 aa  1229    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  100 
 
 
840 aa  1688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  54.63 
 
 
826 aa  854    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  74.59 
 
 
836 aa  1202    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  53.39 
 
 
843 aa  804    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  74.58 
 
 
829 aa  1230    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  72.1 
 
 
836 aa  1160    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  55.79 
 
 
830 aa  875    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  56.59 
 
 
851 aa  880    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  71.07 
 
 
826 aa  1159    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  55.57 
 
 
851 aa  861    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  37.93 
 
 
811 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  36.56 
 
 
821 aa  269  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  36.52 
 
 
807 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  31.86 
 
 
817 aa  251  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  33.91 
 
 
676 aa  248  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  35.69 
 
 
638 aa  247  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  32.9 
 
 
820 aa  243  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  33.24 
 
 
818 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  30.93 
 
 
819 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.44 
 
 
838 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  33.97 
 
 
851 aa  224  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.63 
 
 
878 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  31.41 
 
 
837 aa  217  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  31.51 
 
 
835 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 
1209 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 
1209 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  25.64 
 
 
1237 aa  187  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  28.98 
 
 
651 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.18 
 
 
476 aa  168  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  24.86 
 
 
1224 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  24.83 
 
 
1224 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  24.83 
 
 
1224 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.43 
 
 
366 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  30.68 
 
 
638 aa  117  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  32.79 
 
 
498 aa  64.7  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>