24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4303 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
2122 aa  4265    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  45.76 
 
 
2884 aa  151  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  45.14 
 
 
1452 aa  137  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.71 
 
 
1019 aa  73.9  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  29.65 
 
 
963 aa  73.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  30.86 
 
 
1402 aa  72.8  0.00000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  30.6 
 
 
1562 aa  59.7  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.48 
 
 
3210 aa  57.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  32.31 
 
 
2268 aa  53.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  26.24 
 
 
2281 aa  51.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  26.47 
 
 
3393 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  32.69 
 
 
1172 aa  51.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  40.58 
 
 
1102 aa  50.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  40.58 
 
 
3486 aa  50.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.78 
 
 
3190 aa  50.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  28.07 
 
 
3333 aa  50.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  40.58 
 
 
3242 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  40.58 
 
 
3392 aa  49.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.7 
 
 
1064 aa  48.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  32.35 
 
 
495 aa  48.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  31.33 
 
 
563 aa  47.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  32.73 
 
 
853 aa  48.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  28.19 
 
 
1746 aa  46.2  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  30.12 
 
 
563 aa  45.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>