20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12040 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 1562 aa  3158    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  49.66 
 
 		 883 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  35.86 
 
 		 963 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  46.27 
 
 		 1402 aa  266  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.3 
 
 		 1019 aa  251  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  31.08 
 
 		 2268 aa  178  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.43 
 
 		 1064 aa  150  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  38.6 
 
 		 2281 aa  119  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24300  hypothetical protein  29.03 
 
 		 362 aa  63.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1056  collagen adhesin domain protein  23.96 
 
 		 683 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0194698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  36.75 
 
 		 982 aa  61.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.6 
 
 		 2122 aa  60.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  32.9 
 
 		 495 aa  50.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  33.33 
 
 		 1066 aa  48.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  35.79 
 
 		 4881 aa  46.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  24.21 
 
 		 3242 aa  46.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.3 
 
 		 1112 aa  45.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  30.72 
 
 		 1888 aa  45.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  31.62 
 
 		 3392 aa  45.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.5 
 
 		 3210 aa  45.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>