47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04940 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  100 
 
 		 883 aa  1788    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  49.52 
 
 		 1562 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  31.53 
 
 		 963 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.28 
 
 		 1019 aa  290  7e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  48.39 
 
 		 1402 aa  240  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  26.85 
 
 		 2268 aa  138  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.87 
 
 		 1064 aa  127  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  37.22 
 
 		 2281 aa  112  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.34 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  24.46 
 
 		 607 aa  83.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24300  hypothetical protein  33.89 
 
 		 362 aa  63.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  22.3 
 
 		 982 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.31 
 
 		 3486 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  35.38 
 
 		 3392 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1056  collagen adhesin domain protein  41.67 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0194698  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  38.61 
 
 		 3333 aa  61.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.35 
 
 		 3190 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  35.38 
 
 		 3393 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  34.22 
 
 		 3210 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  34.22 
 
 		 882 aa  59.3  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  36.63 
 
 		 3242 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  23.83 
 
 		 495 aa  55.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  27.68 
 
 		 853 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  37.23 
 
 		 1066 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  23.87 
 
 		 1888 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  23.36 
 
 		 2136 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  32.67 
 
 		 2272 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.86 
 
 		 2179 aa  52  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  31.41 
 
 		 1102 aa  52  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  44.44 
 
 		 4881 aa  51.6  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  35.37 
 
 		 1804 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  33.6 
 
 		 1093 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  27.06 
 
 		 508 aa  49.7  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  34.4 
 
 		 1093 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  31.91 
 
 		 1153 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  31.91 
 
 		 1153 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  38.37 
 
 		 1508 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.78 
 
 		 1112 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.21 
 
 		 1328 aa  47  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  35.56 
 
 		 745 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.84 
 
 		 939 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  33.6 
 
 		 1055 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  34.55 
 
 		 1307 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  44.23 
 
 		 1888 aa  45.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2710  cell wall anchor domain-containing protein  23.6 
 
 		 877 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2654  cell wall anchor domain-containing protein  23.6 
 
 		 877 aa  44.7  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  36.25 
 
 		 1108 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>