52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0961 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 1019 aa  2041    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  36.17 
 
 		 607 aa  310  6.999999999999999e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  33.15 
 
 		 963 aa  306  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  34.28 
 
 		 883 aa  289  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12040  putative collagen-binding protein  47.3 
 
 		 1562 aa  250  1e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.750329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13770  putative collagen-binding protein  43.52 
 
 		 1402 aa  249  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000835075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.9 
 
 		 508 aa  229  3e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  31.06 
 
 		 2268 aa  219  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.09 
 
 		 1064 aa  150  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00090  Mg-chelatase subunit ChlD  37.89 
 
 		 2281 aa  96.3  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.4181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.71 
 
 		 2122 aa  74.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1056  collagen adhesin domain protein  37.86 
 
 		 683 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0194698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0966  collagen adhesin domain-containing protein  38.46 
 
 		 982 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.2 
 
 		 2179 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.39 
 
 		 2272 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24300  hypothetical protein  45.68 
 
 		 362 aa  56.6  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  37.5 
 
 		 853 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  27.09 
 
 		 771 aa  55.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  23.98 
 
 		 2136 aa  55.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.96 
 
 		 3242 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  33.83 
 
 		 745 aa  53.5  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  25.58 
 
 		 3392 aa  52.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  38.14 
 
 		 969 aa  52  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  38.14 
 
 		 969 aa  52  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  43.96 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22940  hypothetical protein  26.35 
 
 		 436 aa  50.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0567594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  43.94 
 
 		 1888 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  41.76 
 
 		 1093 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.63 
 
 		 3210 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.21 
 
 		 3486 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  40.51 
 
 		 971 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  35.24 
 
 		 1102 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.85 
 
 		 1328 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  35.58 
 
 		 1804 aa  48.5  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  42.11 
 
 		 3393 aa  48.5  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  38.04 
 
 		 3190 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  40.21 
 
 		 1508 aa  48.5  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  36.56 
 
 		 731 aa  48.1  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.85 
 
 		 1112 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  40.85 
 
 		 1256 aa  48.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  34.55 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  44.16 
 
 		 1108 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  25.77 
 
 		 2839 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  32.46 
 
 		 975 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  30.6 
 
 		 4909 aa  46.6  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  44.12 
 
 		 540 aa  47  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  40.79 
 
 		 3333 aa  46.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  40.66 
 
 		 1055 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  40.26 
 
 		 1307 aa  45.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0696  hypothetical protein  33.62 
 
 		 455 aa  45.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.420445  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  29.46 
 
 		 4881 aa  44.7  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1637  von Willebrand factor (vWF) domain containing protein  38.37 
 
 		 794 aa  44.7  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>