134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1555 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  100 
 
 
1888 aa  3779    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.07 
 
 
3190 aa  207  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  25.89 
 
 
3333 aa  206  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25.71 
 
 
3393 aa  206  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.18 
 
 
3210 aa  200  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  25.49 
 
 
3242 aa  198  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.77 
 
 
3486 aa  197  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  26.35 
 
 
1804 aa  197  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.81 
 
 
2272 aa  190  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.9 
 
 
1328 aa  187  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.11 
 
 
2179 aa  185  7e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  32.01 
 
 
1508 aa  183  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.84 
 
 
1112 aa  183  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  31.36 
 
 
1307 aa  179  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  29.52 
 
 
3392 aa  179  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  27.01 
 
 
1102 aa  170  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  29.04 
 
 
882 aa  171  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  29.37 
 
 
771 aa  168  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  31.68 
 
 
2136 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.67 
 
 
971 aa  154  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  30.19 
 
 
969 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  30.19 
 
 
969 aa  151  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  31.5 
 
 
1066 aa  145  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  32.2 
 
 
745 aa  135  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  34.7 
 
 
731 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  33.41 
 
 
729 aa  129  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  28.26 
 
 
853 aa  124  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  31.9 
 
 
1093 aa  119  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  31.14 
 
 
1093 aa  115  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  30.89 
 
 
1055 aa  112  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  32.02 
 
 
495 aa  104  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  27.87 
 
 
1207 aa  87.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  25.98 
 
 
714 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  28.19 
 
 
627 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  28.19 
 
 
627 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  29.57 
 
 
718 aa  79.7  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  37.42 
 
 
913 aa  79.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  28.99 
 
 
718 aa  79.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  28.19 
 
 
627 aa  79  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  28.99 
 
 
718 aa  78.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  28.3 
 
 
1256 aa  78.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  34.52 
 
 
928 aa  75.9  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5205  collagen adhesion protein, N-terminus  27.69 
 
 
617 aa  74.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  43.27 
 
 
975 aa  73.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1510  outer membrane protein  25.43 
 
 
790 aa  70.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  41.35 
 
 
939 aa  68.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13730  putative collagen-binding protein  33.33 
 
 
963 aa  62  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  40.98 
 
 
433 aa  62  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  37.04 
 
 
1888 aa  59.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  37.5 
 
 
1108 aa  58.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  31.35 
 
 
4909 aa  58.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  32.86 
 
 
920 aa  58.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  30.17 
 
 
4881 aa  56.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04940  putative collagen-binding protein  26.51 
 
 
883 aa  55.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2129  hypothetical protein  36.71 
 
 
487 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2292  hypothetical protein  37.84 
 
 
222 aa  55.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.99 
 
 
257 aa  55.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.07 
 
 
3927 aa  55.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  34.95 
 
 
497 aa  54.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  35.35 
 
 
2377 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  34.38 
 
 
522 aa  53.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  37.35 
 
 
605 aa  53.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1487  Cna B domain protein  26.12 
 
 
610 aa  53.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  46.43 
 
 
469 aa  52.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.08 
 
 
1867 aa  52.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.56 
 
 
508 aa  52.4  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7652  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  39.13 
 
 
592 aa  52.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  30.95 
 
 
563 aa  52.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0271  TolA protein  32.65 
 
 
436 aa  52  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.640452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  52  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.32822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  36.84 
 
 
1429 aa  51.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4913  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.54 
 
 
507 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  25 
 
 
4798 aa  51.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  32.63 
 
 
242 aa  51.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  31.55 
 
 
563 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  32.63 
 
 
242 aa  51.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  28.57 
 
 
751 aa  51.2  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  32.21 
 
 
1266 aa  50.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  44.19 
 
 
338 aa  50.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03840  putative collagen-binding protein  41.67 
 
 
607 aa  50.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.173471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  25.71 
 
 
727 aa  50.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  47.06 
 
 
510 aa  50.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  29.47 
 
 
1195 aa  50.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2814  Extensin family protein  36 
 
 
338 aa  50.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52695  normal  0.0111316 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  30.17 
 
 
323 aa  50.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.94 
 
 
1019 aa  49.7  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5065  hypothetical protein  33.05 
 
 
301 aa  50.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.201013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  43.18 
 
 
598 aa  49.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.61 
 
 
553 aa  49.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  35.56 
 
 
901 aa  49.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  34.18 
 
 
572 aa  49.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  32.29 
 
 
555 aa  49.3  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  28.92 
 
 
724 aa  49.3  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  34.29 
 
 
467 aa  49.3  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  28.47 
 
 
725 aa  48.9  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  34.67 
 
 
356 aa  48.9  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  26.79 
 
 
292 aa  48.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38 
 
 
470 aa  48.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7074  hypothetical protein  28.35 
 
 
490 aa  48.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0296641  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  30.95 
 
 
563 aa  48.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>