63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0122 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  100 
 
 
1429 aa  2853    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  31.46 
 
 
5517 aa  121  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  29.55 
 
 
745 aa  94  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  31.42 
 
 
1307 aa  79  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.04 
 
 
3190 aa  79  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  30.92 
 
 
3242 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  30.74 
 
 
1102 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  30.33 
 
 
3333 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.74 
 
 
3486 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  32.16 
 
 
1508 aa  75.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  27.82 
 
 
729 aa  74.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.64 
 
 
971 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  32.52 
 
 
3392 aa  73.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.1 
 
 
1328 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  27.27 
 
 
928 aa  72.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  33.82 
 
 
3393 aa  71.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  28.17 
 
 
969 aa  71.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  28.17 
 
 
969 aa  71.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.04 
 
 
1112 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.73 
 
 
3210 aa  70.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  28.7 
 
 
771 aa  69.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  30.63 
 
 
853 aa  68.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  30.04 
 
 
882 aa  66.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  26.57 
 
 
731 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  45.12 
 
 
920 aa  65.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  25.36 
 
 
2272 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.95 
 
 
2179 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  40.51 
 
 
4909 aa  62.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  25.31 
 
 
1066 aa  62  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  28.92 
 
 
913 aa  60.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  27.11 
 
 
1804 aa  59.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.09 
 
 
553 aa  58.9  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  26.47 
 
 
1093 aa  58.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  25.98 
 
 
1093 aa  57.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  26.99 
 
 
1055 aa  57  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
2136 aa  56.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  23.29 
 
 
495 aa  56.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36570  conserved repeat protein  27.96 
 
 
1923 aa  55.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
563 aa  54.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  28.67 
 
 
627 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  29.63 
 
 
718 aa  53.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  31.06 
 
 
4881 aa  53.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  28.89 
 
 
718 aa  52  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  28.89 
 
 
714 aa  52  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  28.79 
 
 
627 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  28.79 
 
 
718 aa  52  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  28.79 
 
 
627 aa  52  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  36.84 
 
 
1888 aa  51.2  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  25.31 
 
 
508 aa  50.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0151  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.29 
 
 
1064 aa  50.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0649  cell wall surface anchor family protein, putative  31.53 
 
 
890 aa  50.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  28.3 
 
 
1108 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  24.83 
 
 
724 aa  49.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  26.71 
 
 
725 aa  48.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  28.89 
 
 
1207 aa  48.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  32.05 
 
 
863 aa  48.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1034  conserved repeat domain protein  25 
 
 
1597 aa  47  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  33.33 
 
 
540 aa  46.2  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  24.9 
 
 
1195 aa  46.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  31.31 
 
 
482 aa  45.8  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1510  Cna B domain protein  23.29 
 
 
1022 aa  45.4  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681138  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  26.67 
 
 
563 aa  45.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  24.74 
 
 
901 aa  45.1  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>