51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  100 
 
 
1195 aa  2451    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  37.64 
 
 
1266 aa  440  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1510  Cna B domain protein  38.43 
 
 
1022 aa  426  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681138  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  29.26 
 
 
1093 aa  296  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  29.37 
 
 
1093 aa  296  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  29.1 
 
 
1055 aa  292  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  29.88 
 
 
1256 aa  189  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  35.03 
 
 
751 aa  186  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  34.96 
 
 
1207 aa  158  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.1 
 
 
723 aa  134  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.22 
 
 
3190 aa  97.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.8 
 
 
3210 aa  95.1  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  26.98 
 
 
714 aa  91.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  26.72 
 
 
718 aa  90.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  26.46 
 
 
718 aa  90.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  29.75 
 
 
745 aa  89.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  26.55 
 
 
3392 aa  89  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  25.4 
 
 
718 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.23 
 
 
3486 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  27.42 
 
 
1508 aa  85.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  24.94 
 
 
1307 aa  85.1  0.000000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  26.17 
 
 
627 aa  85.1  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  26.3 
 
 
2136 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  26.51 
 
 
3333 aa  82.8  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  25.23 
 
 
1102 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  25.37 
 
 
853 aa  82  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  26.96 
 
 
1112 aa  81.6  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  25.62 
 
 
2179 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  25.86 
 
 
627 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  25.86 
 
 
627 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.33 
 
 
1328 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.74 
 
 
971 aa  77  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  23.85 
 
 
3393 aa  75.5  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  24.69 
 
 
2272 aa  75.5  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  26.45 
 
 
969 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  26.45 
 
 
969 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  26.32 
 
 
3242 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0909  Cna B domain protein  30.23 
 
 
1888 aa  70.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.67463  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  25.19 
 
 
729 aa  69.7  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  26.94 
 
 
882 aa  68.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  24.13 
 
 
731 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  26 
 
 
771 aa  63.2  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  28.29 
 
 
1066 aa  58.2  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  26.9 
 
 
1804 aa  55.5  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0413  Cna B domain-containing protein  29.12 
 
 
538 aa  55.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  29.47 
 
 
1888 aa  50.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  27.43 
 
 
724 aa  50.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5331  peptidoglycan binding protein  23.62 
 
 
564 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  25.39 
 
 
725 aa  46.6  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  24.9 
 
 
1429 aa  46.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  29.94 
 
 
913 aa  45.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>