25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1612 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
723 aa  1446    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  32.73 
 
 
1055 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  31.68 
 
 
1093 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  31.25 
 
 
1093 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  38.1 
 
 
1195 aa  134  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  37.1 
 
 
1207 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1510  Cna B domain protein  35.58 
 
 
1022 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681138  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  34.57 
 
 
1256 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18990  putative collagen-binding protein  36.12 
 
 
1266 aa  114  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00450  hypothetical protein  29.93 
 
 
393 aa  111  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472915  normal  0.53291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0164  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.53 
 
 
412 aa  107  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0167  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.14 
 
 
408 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.926777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0161  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.11 
 
 
416 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.359865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0607  surface protein  28.61 
 
 
414 aa  99.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0608  surface protein  30.15 
 
 
388 aa  89.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0168  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.18 
 
 
389 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.36 
 
 
2179 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1355  Cna B domain protein  34.02 
 
 
751 aa  53.1  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000416795  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  38.64 
 
 
969 aa  50.8  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  38.64 
 
 
969 aa  50.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2123  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.78 
 
 
328 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  51.67 
 
 
2272 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.41 
 
 
971 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  46.77 
 
 
2136 aa  45.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  35.29 
 
 
346 aa  45.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>