52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0146 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  87.6 
 
 		 724 aa  1263    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 		 725 aa  1451    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  32.7 
 
 		 969 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  32.7 
 
 		 969 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.7 
 
 		 971 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  31.28 
 
 		 731 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.73 
 
 		 1112 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  31.48 
 
 		 729 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.16 
 
 		 3190 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.16 
 
 		 3210 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  27.11 
 
 		 928 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  24.26 
 
 		 920 aa  62.4  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.41 
 
 		 3486 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  27.82 
 
 		 745 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  31.41 
 
 		 3333 aa  60.8  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  31.41 
 
 		 3393 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  31.41 
 
 		 3392 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  31.22 
 
 		 882 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  31.89 
 
 		 1307 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  28.82 
 
 		 1102 aa  58.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  31.02 
 
 		 3242 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  26.56 
 
 		 1066 aa  58.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.34 
 
 		 1328 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  37.32 
 
 		 1508 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  31.25 
 
 		 1804 aa  54.3  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  28.05 
 
 		 4881 aa  53.5  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  27.12 
 
 		 1093 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  26.55 
 
 		 1093 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  23.71 
 
 		 853 aa  50.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  24.24 
 
 		 771 aa  49.7  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  28.47 
 
 		 1888 aa  49.7  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  25.99 
 
 		 1055 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0646  cell wall surface anchor family protein  24.81 
 
 		 307 aa  48.9  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  29.56 
 
 		 1256 aa  48.5  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  28.4 
 
 		 539 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  26.71 
 
 		 1429 aa  48.9  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5157  cell wall anchor domain-containing protein  25.77 
 
 		 2268 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  27.95 
 
 		 718 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  30.57 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  30.43 
 
 		 549 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08160  putative collagen-binding protein  25.39 
 
 		 1195 aa  46.6  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000954131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.64 
 
 		 2272 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1487  Cna B domain protein  28.8 
 
 		 610 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  26.71 
 
 		 627 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  27.98 
 
 		 718 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  34.83 
 
 		 563 aa  45.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0188  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.37 
 
 		 508 aa  44.7  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  27.18 
 
 		 2179 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  27.33 
 
 		 714 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  29.94 
 
 		 522 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  27.33 
 
 		 718 aa  44.3  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  27.07 
 
 		 634 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>