48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0147 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  96.74 
 
 		 522 aa  1004    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  100 
 
 		 522 aa  1037    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  32.38 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  27.31 
 
 		 539 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  26.13 
 
 		 549 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  28.57 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  27.03 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.55 
 
 		 2272 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.68 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  29.25 
 
 		 2136 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.38 
 
 		 2179 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  29.41 
 
 		 705 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  24.27 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  28.5 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0645  cell wall surface anchor family protein  25 
 
 		 554 aa  57  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  35.21 
 
 		 1328 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  26.61 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.67 
 
 		 1112 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  28.77 
 
 		 563 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  32.4 
 
 		 729 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  31.03 
 
 		 1804 aa  54.3  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  34.27 
 
 		 1307 aa  53.9  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  27.61 
 
 		 745 aa  53.9  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  41.94 
 
 		 1508 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  26.95 
 
 		 1108 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  39.02 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  28.3 
 
 		 563 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  39.22 
 
 		 731 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  39.02 
 
 		 1093 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1164  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.06 
 
 		 597 aa  50.8  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000159118 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.77 
 
 		 553 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.32 
 
 		 971 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  37.8 
 
 		 1093 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  37.38 
 
 		 969 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  37.38 
 
 		 969 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  26.35 
 
 		 920 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.66 
 
 		 3190 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  31.06 
 
 		 1102 aa  45.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  39.53 
 
 		 3486 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  37.21 
 
 		 3333 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  29.94 
 
 		 725 aa  44.3  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  39.33 
 
 		 913 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  34.09 
 
 		 975 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  26.39 
 
 		 634 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  37.21 
 
 		 3242 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  38.37 
 
 		 3392 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  33.33 
 
 		 771 aa  43.5  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  38.37 
 
 		 3393 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>