45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0123 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 		 634 aa  1274    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 508 aa  92  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0645  cell wall surface anchor family protein  28.96 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5331  peptidoglycan binding protein  23 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  24.07 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5388  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.03 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  24.19 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.31 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  32.42 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  32.14 
 
 		 3333 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.14 
 
 		 3486 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  32.86 
 
 		 3392 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  32.14 
 
 		 3393 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.11 
 
 		 3190 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  28.72 
 
 		 745 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  25.35 
 
 		 533 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.76 
 
 		 3210 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  36.45 
 
 		 3242 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  39.47 
 
 		 882 aa  50.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 969 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  26.48 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 971 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 969 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  25.34 
 
 		 539 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  23.96 
 
 		 729 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 1328 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  29.13 
 
 		 705 aa  48.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  43.66 
 
 		 495 aa  48.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  44.16 
 
 		 771 aa  48.1  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.33 
 
 		 1112 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  33.33 
 
 		 1508 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  33.64 
 
 		 731 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1453  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.77 
 
 		 730 aa  47.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  27.44 
 
 		 920 aa  46.6  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  22.56 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  25.48 
 
 		 901 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  26.39 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  30.13 
 
 		 1804 aa  45.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  32.17 
 
 		 724 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  30.77 
 
 		 1108 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  24.8 
 
 		 480 aa  44.3  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  27.07 
 
 		 725 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  29.7 
 
 		 1066 aa  44.3  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  26.39 
 
 		 522 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  23.81 
 
 		 2272 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>