32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00830 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  84.41 
 
 
480 aa  754    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  100 
 
 
482 aa  953    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  66.67 
 
 
475 aa  585  1e-166  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  24.74 
 
 
549 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  28.52 
 
 
540 aa  92.8  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  36.36 
 
 
533 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  25.74 
 
 
522 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  26.79 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  30.35 
 
 
539 aa  73.6  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  30.99 
 
 
508 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  27.75 
 
 
901 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  34.08 
 
 
563 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  34.59 
 
 
563 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  32.47 
 
 
920 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  33.52 
 
 
563 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  42.25 
 
 
4909 aa  49.3  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0649  cell wall surface anchor family protein, putative  24.11 
 
 
890 aa  48.9  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  26.48 
 
 
634 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  27.59 
 
 
705 aa  48.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1524  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.69 
 
 
639 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0829839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  30.77 
 
 
1804 aa  47  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  31.31 
 
 
1429 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0033  collagen adhesion protein  33.96 
 
 
853 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000039957  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  41.94 
 
 
1307 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  31.18 
 
 
863 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1453  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.46 
 
 
730 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  29.73 
 
 
4881 aa  44.3  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  41.43 
 
 
1112 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  41.94 
 
 
1508 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  27.09 
 
 
2272 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  30.91 
 
 
627 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  33.7 
 
 
771 aa  43.1  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>