28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1262 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 		 475 aa  944    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  66.25 
 
 		 482 aa  578  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  65.97 
 
 		 480 aa  578  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  26.91 
 
 		 549 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  27.72 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  26.15 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  26.16 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  31.28 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  28.43 
 
 		 920 aa  60.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  34.81 
 
 		 563 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  34.07 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  35.04 
 
 		 4881 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  28.13 
 
 		 539 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  33.83 
 
 		 563 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  34.71 
 
 		 771 aa  55.1  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1487  Cna B domain protein  24.62 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.52 
 
 		 553 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  30.25 
 
 		 705 aa  51.6  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  29.37 
 
 		 729 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  25.61 
 
 		 508 aa  50.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  41.43 
 
 		 1804 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  48.98 
 
 		 1888 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0123  cell wall surface anchor family protein  22.56 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  41.67 
 
 		 1508 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  38.89 
 
 		 4909 aa  45.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0649  cell wall surface anchor family protein, putative  27.81 
 
 		 890 aa  44.3  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  39.68 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  28.35 
 
 		 731 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>