38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05670 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  100 
 
 
540 aa  1074    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  32.32 
 
 
549 aa  156  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  28.95 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  30.16 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  28.57 
 
 
522 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  27.8 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.56 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  28.45 
 
 
522 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  25.71 
 
 
508 aa  64.3  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  33.58 
 
 
771 aa  61.6  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36 
 
 
3190 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  26.22 
 
 
533 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  27.62 
 
 
1104 aa  57  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  50 
 
 
563 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  50 
 
 
563 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  35.19 
 
 
495 aa  54.3  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  44.29 
 
 
3393 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  43.75 
 
 
3210 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  32.82 
 
 
863 aa  50.4  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  43.75 
 
 
1102 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  43.75 
 
 
3486 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  43.75 
 
 
3333 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  30 
 
 
724 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  27.91 
 
 
4881 aa  47.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  31.01 
 
 
920 aa  47  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  35.85 
 
 
1508 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0961  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.12 
 
 
1019 aa  47  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.796478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  39.73 
 
 
3392 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0122  Cna B domain-containing protein  33.33 
 
 
1429 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  34.91 
 
 
1328 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  40.91 
 
 
563 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  38.36 
 
 
882 aa  45.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01370  putative collagen-binding protein  33.9 
 
 
1207 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0900922  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  37.33 
 
 
3242 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  26.81 
 
 
928 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  44.62 
 
 
2179 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  42.19 
 
 
1066 aa  43.9  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  39.39 
 
 
1804 aa  43.9  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>