48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0771 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  100 
 
 
549 aa  1101    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  31.87 
 
 
540 aa  155  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1468  hypothetical protein  28.76 
 
 
539 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1262  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.82 
 
 
475 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0147  putative surface protein  26.13 
 
 
522 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.389776  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00810  Cna protein B-type domain-containing protein  25.22 
 
 
480 aa  94  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00133256  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0145  putative surface protein  25.63 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.875356  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00830  Cna protein B-type domain-containing protein  25.64 
 
 
482 aa  88.6  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.444591  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24320  putative collagen-binding protein  27.2 
 
 
533 aa  82  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2536  collagen adhesion protein  27.57 
 
 
563 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2787  collagen adhesion protein  27.49 
 
 
563 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0888016  hitchhiker  0.00000000052982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3114  cell wall anchor domain-containing protein  27.22 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1454  Cna B domain protein  35.71 
 
 
4881 aa  58.5  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1857  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.3 
 
 
553 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  38.95 
 
 
1804 aa  57.4  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0645  cell wall surface anchor family protein  25.61 
 
 
554 aa  54.7  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  27.91 
 
 
1104 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1534  hypothetical protein  25.69 
 
 
508 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.300415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1453  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.66 
 
 
730 aa  50.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.1 
 
 
1112 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1407  cell wall surface anchor family protein  32.26 
 
 
705 aa  49.7  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  29.07 
 
 
1508 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  29.03 
 
 
729 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3112  cell wall anchor domain-containing protein  33.11 
 
 
745 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1164  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25 
 
 
597 aa  47.4  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000159118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0776  cell wall anchor domain-containing protein  28.46 
 
 
1307 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  41.94 
 
 
3210 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1509  outer membrane protein  45.45 
 
 
495 aa  46.6  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  45.76 
 
 
3190 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  46.77 
 
 
3333 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  45.16 
 
 
3392 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  40.96 
 
 
1102 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5388  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  28.46 
 
 
564 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  46.77 
 
 
882 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0146  cell wall surface anchor family protein  30.43 
 
 
725 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  43.55 
 
 
3393 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  48.65 
 
 
1066 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  30.82 
 
 
863 aa  45.1  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  40.96 
 
 
3486 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1555  cell wall anchor domain-containing protein  39.29 
 
 
1888 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0144  peptidoglycan bound protein  30.25 
 
 
724 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  28.95 
 
 
731 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  29.1 
 
 
1328 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  42.59 
 
 
4909 aa  43.9  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5331  peptidoglycan binding protein  27.91 
 
 
564 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  25.16 
 
 
928 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  25.17 
 
 
920 aa  43.9  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0649  cell wall surface anchor family protein, putative  26.77 
 
 
890 aa  43.9  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>